Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AGG8 Date Thu Jan 5 11:29:05 GMT 2012 Unique Job ID 5989de5b2aa84641

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	L	N	L	V	S	E	Q	L	L	A	A	N	G	L	K	H	Q	D	L	F	A	I	L	G	Q	L	A	E	R	R	L	D	Y	G	D	L	Y	F	Q	S	S	Y	H	E	S	W	V	L	E	D	R	I	I	K	D	G	S	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?								?	?	?		?																																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	I	D	Q	G	V	G	V	R	A	I	S	G	E	K	T	G	F	A	Y	A	D	Q	I	S	L	L	A	L	E	Q	S	A	Q	A	A	R	T	I	V	R	D	S	G	D	G	K	V	Q	T	L	G	A	V	E	H	S	P	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																										?		?							?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	S	V	D	P	L	Q	S	M	S	R	E	E	K	L	D	I	L	R	R	V	D	K	V	A	R	E	A	D	K	R	V	Q	E	V	T	A	S	L	S	G	V	Y	E	L	I	L	V	A	A	T	D	G	T	L	A	A	D	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	L	V	R	L	S	V	S	V	L	V	E	E	D	G	K	R	E	R	G	A	S	G	G	G	G	R	F	G	Y	E	F	F	L	A	D	L	D	G	E	V	R	A	D	A	W	A	K	E	A	V	R	M	A	L	V	N	L	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?				?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?																			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	A	A	P	A	G	T	M	P	V	V	L	G	A	G	W	P	G	V	L	L	H	E	A	V	G	H	G	L	E	G	D	F	N	R	R	G	T	S	V	F	S	G	Q	V	G	E	L	V	A	S	E	L	C	T	V	V	D	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	M	V	D	R	R	G	S	V	A	I	D	D	E	G	T	P	G	Q	Y	N	V	L	I	E	N	G	I	L	K	G	Y	M	Q	D	K	L	N	A	R	L	M	G	M	T	P	T	G	N	G	R	R	E	S	Y	A	H	L	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																																																?	?	?		?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	R	M	T	N	T	Y	M	L	P	G	K	S	T	P	Q	E	I	I	E	S	V	E	Y	G	I	Y	A	P	N	F	G	G	G	Q	V	D	I	T	S	G	K	F	V	F	S	T	S	E	A	Y	L	I	E	N	G	K	V	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	V	K	G	A	T	L	I	G	S	G	I	E	T	M	Q	Q	I	S	M	V	G	N	D	L	K	L	D	N	G	V	G	V	C	G	K	E	G	Q	S	L	P	V	G	V	G	Q	P	T	L	K	V	D	N	L	T	V	G	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?											?																?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand