Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76562 Date Thu Jan 5 12:24:40 GMT 2012 Unique Job ID 597639b2508e4731

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	E	L	T	A	L	H	T	L	T	A	Q	M	K	R	E	G	I	R	R	L	L	V	L	S	G	E	E	G	W	C	F	E	H	T	L	K	L	R	D	A	L	P	G	D	W	L	W	I	S	P	R	P	D	A	E	N	H	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	P	S	A	L	Q	T	L	L	G	R	E	F	R	H	A	V	F	D	A	R	H	G	F	D	A	A	A	F	A	A	L	S	G	T	L	K	A	G	S	W	L	V	L	L	L	P	V	W	E	E	W	E	N	Q	P	D	A	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	R	W	S	D	C	P	D	P	I	A	T	P	H	F	V	Q	H	L	K	R	V	L	T	A	D	N	E	A	I	L	W	R	Q	N	Q	P	F	S	L	A	H	F	T	P	R	T	D	W	Y	P	A	T	G	A	P	Q	P	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	Q	L	L	K	Q	L	M	T	M	P	P	G	V	A	A	V	T	A	A	R	G	R	G	K	S	A	L	A	G	Q	L	I	S	R	I	A	G	R	A	I	V	T	A	P	A	K	A	S	T	D	V	L	A	Q	F	A	G	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	R	F	I	A	P	D	A	L	L	A	S	D	E	Q	A	D	W	L	V	V	D	E	A	A	A	I	P	A	P	L	L	H	Q	L	V	S	R	F	P	R	T	L	L	T	T	T	V	Q	G	Y	E	G	T	G	R	G	F	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	F	C	A	R	F	P	H	L	H	R	F	E	L	Q	Q	P	I	R	W	A	Q	G	C	P	L	E	K	M	V	S	E	A	L	V	F	D	D	E	N	F	T	H	T	P	Q	G	N	I	V	I	S	A	F	E	Q	T	L	W	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	D	P	E	T	P	L	K	V	Y	Q	L	L	S	G	A	H	Y	R	T	S	P	L	D	L	R	R	M	M	D	A	P	G	Q	H	F	L	Q	A	A	G	E	N	E	I	A	G	A	L	W	L	V	D	E	G	G	L	S	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	S	Q	A	V	W	A	G	F	R	R	P	R	G	N	L	V	A	Q	S	L	A	A	H	G	N	N	P	L	A	A	T	L	R	G	R	R	V	S	R	I	A	V	H	P	A	R	Q	R	E	G	T	G	R	Q	L	I	A	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	Q	Y	T	Q	D	L	D	Y	L	S	V	S	F	G	Y	T	G	E	L	W	R	F	W	Q	R	C	G	F	V	L	V	R	M	G	N	H	R	E	A	S	S	G	C	Y	T	A	M	A	L	L	P	M	S	D	A	G	K	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	E	R	E	H	Y	R	L	R	R	D	A	Q	A	L	A	Q	W	N	G	E	T	L	P	V	D	P	L	N	D	A	V	L	S	D	D	D	W	L	E	L	A	G	F	A	F	A	H	R	P	L	L	T	S	L	G	C	L	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	L	Q	T	S	E	L	A	L	P	A	L	R	G	R	L	Q	K	N	A	S	D	A	Q	L	C	T	T	L	K	L	S	G	R	K	M	L	L	V	R	Q	R	E	E	A	A	Q	A	L	F	A	L	N	D	V	R	T	E	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.
Sequence		R	D	R	I	T	Q	W	Q	L	F	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand