Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37127 Date Thu Jan 5 11:54:48 GMT 2012 Unique Job ID 592f7691ce8dd7c3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	R	F	I	M	A	N	S	Q	Q	C	L	G	C	H	A	C	E	I	A	C	V	M	A	H	N	D	E	Q	H	V	L	S	Q	H	H	F	H	P	R	I	T	V	I	K	H	Q	Q	Q	R	S	A	V	T	C	H	H	C	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	A	P	C	A	R	S	C	P	N	G	A	I	S	H	V	D	D	S	I	Q	V	N	Q	Q	K	C	I	G	C	K	S	C	V	V	A	C	P	F	G	T	M	Q	I	V	L	T	P	V	A	A	G	K	V	K	A	T	A	H	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		C	D	L	C	A	G	R	E	N	G	P	A	C	V	E	N	C	P	A	D	A	L	Q	L	V	T	D	V	A	L	S	G	M	A	K	S	R	R	L	R	T	A	R	Q	E	H	Q	P	W	H	A	S	T	A	A	Q	E	M	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?		?								?	?	?	?	?	?	?		?	?		?	?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	S	K	V	E	Q	M	Q	A	T	P	A	R	G	E	P	D	K	L	A	I	E	A	R	K	T	G	F	D	E	I	Y	L	P	F	R	A	D	Q	A	Q	R	E	A	S	R	C	L	K	C	G	E	H	S	V	C	E	W	T	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?		?	?	?	?		?		?																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	L	H	N	H	I	P	Q	W	I	E	L	V	K	A	G	N	I	D	A	A	V	E	L	S	H	Q	T	N	T	L	P	E	I	T	G	R	V	C	P	Q	D	R	L	C	E	G	A	C	T	I	R	D	E	H	G	A	V	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	N	I	E	R	Y	I	S	D	Q	A	L	A	K	G	W	R	P	D	L	S	H	V	T	K	V	D	K	R	V	A	I	I	G	A	G	P	A	G	L	A	C	A	D	V	L	T	R	N	G	V	G	V	T	V	Y	D	R	H	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	I	G	G	L	L	T	F	G	I	P	S	F	K	L	D	K	S	L	L	A	R	R	R	E	I	F	S	A	M	G	I	H	F	E	L	N	C	E	V	G	K	D	V	S	L	D	S	L	L	E	Q	Y	D	A	V	F	V	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	T	Y	R	S	M	K	A	G	L	P	N	E	D	A	P	G	V	Y	D	A	L	P	F	L	I	A	N	T	K	Q	V	M	G	L	E	E	L	P	E	E	P	F	I	N	T	A	G	L	N	V	V	V	L	G	G	G	D	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	D	C	V	R	T	A	L	R	H	G	A	S	N	V	T	C	A	Y	R	R	D	E	A	N	M	P	G	S	K	K	E	V	K	N	A	R	E	E	G	A	N	F	E	F	N	V	Q	P	V	A	L	E	L	N	E	Q	G	H	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		C	G	I	R	F	L	R	T	R	L	G	E	P	D	A	Q	G	R	R	R	P	V	P	V	E	G	S	E	F	V	M	P	A	D	A	V	I	M	A	F	G	F	N	P	H	G	M	P	W	L	E	S	H	G	V	T	V	D	K	W
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	R	I	I	A	D	V	E	S	Q	Y	R	Y	Q	T	T	N	P	K	I	F	A	G	G	D	A	V	R	G	A	D	L	V	V	T	A	M	A	E	G	R	H	A	A	Q	G	I	I	D	W	L	G	V	K	S	V	K	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?			?	?																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand