Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P07024 Date Thu Jan 5 11:00:06 GMT 2012 Unique Job ID 592ceb36e25cec7a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	L	L	Q	R	G	V	A	L	A	L	L	T	T	F	T	L	A	S	E	T	A	L	A	Y	E	Q	D	K	T	Y	K	I	T	V	L	H	T	N	D	H	H	G	H	F	W	R	N	E	Y	G	E	Y	G	L	A	A	Q	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	L	V	D	G	I	R	K	E	V	A	A	E	G	G	S	V	L	L	L	S	G	G	D	I	N	T	G	V	P	E	S	D	L	Q	D	A	E	P	D	F	R	G	M	N	L	V	G	Y	D	A	M	A	I	G	N	H	E	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	P	L	T	V	L	R	Q	Q	E	K	W	A	K	F	P	L	L	S	A	N	I	Y	Q	K	S	T	G	E	R	L	F	K	P	W	A	L	F	K	R	Q	D	L	K	I	A	V	I	G	L	T	T	D	D	T	A	K	I	G	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	E	Y	F	T	D	I	E	F	R	K	P	A	D	E	A	K	L	V	I	Q	E	L	Q	Q	T	E	K	P	D	I	I	I	A	A	T	H	M	G	H	Y	D	N	G	E	H	G	S	N	A	P	G	D	V	E	M	A	R	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	A	G	S	L	A	M	I	V	G	G	H	S	Q	D	P	V	C	M	A	A	E	N	K	K	Q	V	D	Y	V	P	G	T	P	C	K	P	D	Q	Q	N	G	I	W	I	V	Q	A	H	E	W	G	K	Y	V	G	R	A	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?		?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	F	R	N	G	E	M	K	M	V	N	Y	Q	L	I	P	V	N	L	K	K	K	V	T	W	E	D	G	K	S	E	R	V	L	Y	T	P	E	I	A	E	N	Q	Q	M	I	S	L	L	S	P	F	Q	N	K	G	K	A	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	V	K	I	G	E	T	N	G	R	L	E	G	D	R	D	K	V	R	F	V	Q	T	N	M	G	R	L	I	L	A	A	Q	M	D	R	T	G	A	D	F	A	V	M	S	G	G	G	I	R	D	S	I	E	A	G	D	I	S	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	N	V	L	K	V	Q	P	F	G	N	V	V	V	Y	A	D	M	T	G	K	E	V	I	D	Y	L	T	A	V	A	Q	M	K	P	D	S	G	A	Y	P	Q	F	A	N	V	S	F	V	A	K	D	G	K	L	N	D	L	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		K	G	E	P	V	D	P	A	K	T	Y	R	M	A	T	L	N	F	N	A	T	G	G	D	G	Y	P	R	L	D	N	K	P	G	Y	V	N	T	G	F	I	D	A	E	V	L	K	A	Y	I	Q	K	S	S	P	L	D	V	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Sequence		Y	E	P	K	G	E	V	S	W	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand