Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P60872 Date Thu Jan 5 12:07:13 GMT 2012 Unique Job ID 5843cebe03b081a4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	D	I	A	L	T	V	S	I	L	A	L	V	A	V	V	G	L	F	I	G	N	V	K	F	R	G	I	G	L	G	I	G	G	V	L	F	G	G	I	I	V	G	H	F	V	S	Q	A	G	M	T	L	S	S	D	M	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																						?																						?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	I	Q	E	F	G	L	I	L	F	V	Y	T	I	G	I	Q	V	G	P	G	F	F	A	S	L	R	V	S	G	L	R	L	N	L	F	A	V	L	I	V	I	I	G	G	L	V	T	A	I	L	H	K	L	F	D	I	P	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	V	L	G	I	F	S	G	A	V	T	N	T	P	A	L	G	A	G	Q	Q	I	L	R	D	L	G	T	P	M	E	M	V	D	Q	M	G	M	S	Y	A	M	A	Y	P	F	G	I	C	G	I	L	F	T	M	W	M	L	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	F	R	V	N	V	E	T	E	A	Q	Q	H	E	S	S	R	T	N	G	G	A	L	I	K	T	I	N	I	R	V	E	N	P	N	L	H	D	L	A	I	K	D	V	P	I	L	N	G	D	K	I	I	C	S	R	L	K	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	T	L	K	V	P	S	P	D	T	I	I	Q	L	G	D	L	L	H	L	V	G	Q	P	A	D	L	H	N	A	Q	L	V	I	G	Q	E	V	D	T	S	L	S	T	K	G	T	D	L	R	V	E	R	V	V	V	T	N	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?	?	?	?	?										?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	L	G	K	R	I	R	D	L	H	F	K	E	R	Y	D	V	V	I	S	R	L	N	R	A	G	V	E	L	V	A	S	G	D	I	S	L	Q	F	G	D	I	L	N	L	V	G	R	P	S	A	I	D	A	V	A	N	V	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?							?															?				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	A	Q	Q	K	L	Q	Q	V	Q	M	L	P	V	F	I	G	I	G	L	G	V	L	L	G	S	I	P	V	F	V	P	G	F	P	A	A	L	K	L	G	L	A	G	G	P	L	I	M	A	L	I	L	G	R	I	G	S	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	L	Y	W	F	M	P	P	S	A	N	L	A	L	R	E	L	G	I	V	L	F	L	S	V	V	G	L	K	S	G	G	D	F	V	N	T	L	V	N	G	E	G	L	S	W	I	G	Y	G	A	L	I	T	A	V	P	L	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	G	I	L	A	R	M	L	A	K	M	N	Y	L	T	M	C	G	M	L	A	G	S	M	T	D	P	P	A	L	A	F	A	N	N	L	H	P	T	S	G	A	A	A	L	S	Y	A	T	V	Y	P	L	V	M	F	L	R	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?													?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Sequence		T	P	Q	L	L	A	V	L	F	W	S	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand