Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39829 Date Thu Jan 5 12:00:53 GMT 2012 Unique Job ID 5823a77f3a0672ae

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	N	I	E	I	R	Q	E	T	P	T	A	F	Y	I	K	V	H	D	T	D	N	V	A	I	I	V	N	D	N	G	L	K	A	G	T	R	F	P	D	G	L	E	L	I	E	H	I	P	Q	G	H	K	V	A	L	L	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?	?	?		?	?	?	?																	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	A	N	G	E	I	I	R	Y	G	E	V	I	G	Y	A	V	R	A	I	P	R	G	S	W	I	D	E	S	M	V	V	L	P	E	A	P	P	L	H	T	L	P	L	A	T	K	V	P	E	P	L	P	P	L	E	G	Y	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	G	Y	R	N	A	D	G	S	V	G	T	K	N	L	L	G	I	T	T	S	V	H	C	V	A	G	V	V	D	Y	V	V	K	I	I	E	R	D	L	L	P	K	Y	P	N	V	D	G	V	V	G	L	N	H	L	Y	G	C	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	A	I	N	A	P	A	A	V	V	P	I	R	T	I	H	N	I	S	L	N	P	N	F	G	G	E	V	M	V	I	G	L	G	C	E	K	L	Q	P	E	R	L	L	T	G	T	D	D	V	Q	A	I	P	V	E	S	A	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																																															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	S	L	Q	D	E	K	H	V	G	F	Q	S	M	V	E	D	I	L	Q	I	A	E	R	H	L	Q	K	L	N	Q	R	Q	R	E	T	C	P	A	S	E	L	V	V	G	M	Q	C	G	G	S	D	A	F	S	G	V	T	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	A	V	G	Y	A	S	D	L	L	V	R	C	G	A	T	V	M	F	S	E	V	T	E	V	R	D	A	I	H	L	L	T	P	R	A	V	N	E	E	V	G	K	R	L	L	E	E	M	E	W	Y	D	N	Y	L	N	M	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	D	R	S	A	N	P	S	P	G	N	K	K	G	G	L	A	N	V	V	E	K	A	L	G	S	I	A	K	S	G	K	S	A	I	V	E	V	L	S	P	G	Q	R	P	T	K	R	G	L	I	Y	A	A	T	P	A	S	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	C	G	T	Q	Q	V	A	S	G	I	T	V	Q	V	F	T	T	G	R	G	T	P	Y	G	L	M	A	V	P	V	I	K	M	A	T	R	T	E	L	A	N	R	W	F	D	L	M	D	I	N	A	G	T	I	A	T	G	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Sequence		T	I	E	E	V	G	W	K	L	F	H	F	I	L	D	V	A	S	G	K	K	K	T	F	S	D	Q	W	G	L	H	N	Q	L	A	V	F	N	P	A	P	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?			?		?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand