Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33340 Date Thu Jan 5 11:51:38 GMT 2012 Unique Job ID 57acc7d01ead85ed

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	I	R	I	M	L	F	I	L	M	M	M	V	M	P	V	S	Y	A	A	C	Y	S	E	L	S	V	Q	H	N	L	V	V	Q	G	D	F	A	L	T	Q	T	Q	M	A	T	Y	E	H	N	F	N	D	S	S	C	V	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?												?		?	?	?	?									?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?			?			?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	T	I	T	P	M	S	P	S	D	I	I	V	G	L	Y	N	D	T	I	K	L	N	L	H	F	E	W	T	N	K	N	N	I	T	L	S	N	N	Q	T	S	F	T	S	G	Y	S	V	T	V	T	P	A	A	S	N	A	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																												?	?	?	?	?	?		?	?		?	?	?			?	?	?								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	V	S	A	G	G	G	G	S	V	M	I	N	G	V	A	T	L	S	S	A	S	S	S	T	R	G	S	A	A	V	Q	F	L	L	C	L	L	G	G	K	S	W	D	A	C	V	N	S	Y	R	N	A	L	A	Q	N	A	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?		?	?						?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	S	F	N	L	T	L	S	Y	N	P	I	T	T	T	C	K	P	D	D	L	L	I	T	L	D	S	I	P	V	S	Q	L	P	A	T	G	N	K	A	T	I	N	S	K	Q	G	D	I	I	L	R	C	K	N	L	L	G	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?				?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	Q	T	S	R	K	M	Q	V	Y	L	S	S	S	D	L	L	T	N	S	N	T	I	L	K	G	A	E	D	N	G	V	G	F	I	L	E	S	N	G	S	P	V	T	L	L	N	I	T	N	S	S	K	G	Y	T	N	L	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?												?		?		?	?	?	?				?	?	?												?		?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Sequence		V	A	A	K	S	K	L	T	D	T	T	V	S	I	P	I	T	A	S	Y	Y	V	Y	D	T	N	K	V	K	S	G	A	L	E	A	T	A	L	I	N	V	K	Y	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?																?			?	?	?	?	?											?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand