Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ACE0 Date Thu Jan 5 11:17:59 GMT 2012 Unique Job ID 57a08e5f3dc1c560

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	Q	R	I	T	I	D	P	V	T	R	I	E	G	H	L	R	I	D	C	E	I	E	N	G	V	V	S	K	A	W	A	S	G	T	M	W	R	G	M	E	E	I	V	K	N	R	D	P	R	D	A	W	M	I	V	Q	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		C	G	V	C	T	T	T	H	A	L	S	S	V	R	A	A	E	S	A	L	N	I	D	V	P	V	N	A	Q	Y	I	R	N	I	I	L	A	A	H	T	T	H	D	H	I	V	H	F	Y	Q	L	S	A	L	D	W	V	D	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	A	L	Q	A	D	P	T	K	A	S	E	M	L	K	G	V	S	T	W	H	L	N	S	P	E	E	F	T	K	V	Q	N	K	I	K	D	L	V	A	S	G	Q	L	G	I	F	A	N	G	Y	W	G	H	P	A	M	K	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?		?	?	?										?	?		?	?	?																		?							?		?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	E	V	N	L	I	A	V	A	H	Y	L	Q	A	L	E	C	Q	R	D	A	N	R	V	V	A	L	L	G	G	K	T	P	H	I	Q	N	L	A	V	G	G	V	A	N	P	I	N	L	D	G	L	G	V	L	N	L	E	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	Y	I	K	S	F	I	D	K	L	S	D	F	V	E	Q	V	Y	K	V	D	T	A	V	I	A	A	F	Y	P	E	W	L	T	R	G	K	G	A	V	N	Y	L	S	V	P	E	F	P	T	D	S	K	N	G	S	F	L	F	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	G	Y	I	E	N	A	D	L	S	S	Y	R	P	I	T	S	H	S	D	E	Y	L	I	K	G	I	Q	E	S	A	K	H	S	W	Y	K	D	E	A	P	Q	A	P	W	E	G	T	T	I	P	A	Y	D	G	W	S	D	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?			?		?			?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	Y	S	W	V	K	S	P	T	F	Y	G	K	T	V	E	V	G	P	L	A	N	M	L	V	K	L	A	A	G	R	E	S	T	Q	N	K	L	N	E	I	V	A	I	Y	Q	K	L	T	G	N	T	L	E	V	A	Q	L	H	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?		?	?	?																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	L	G	R	I	I	G	R	T	V	H	C	C	E	L	Q	D	I	L	Q	N	Q	Y	S	A	L	I	T	N	I	G	K	G	D	H	T	T	F	V	K	P	N	I	P	A	T	G	E	F	K	G	V	G	F	L	E	A	P	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	L	S	H	W	M	V	I	K	D	G	I	I	S	N	Y	Q	A	V	V	P	S	T	W	N	S	G	P	R	N	F	N	D	D	V	G	P	Y	E	Q	S	L	V	G	T	P	V	A	D	P	N	K	P	L	E	V	V	R	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		H	S	F	D	P	C	M	A	C	A	V	H	V	V	D	A	D	G	N	E	V	V	S	V	K	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?	?								?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand