Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31549 Date Thu Jan 5 11:48:08 GMT 2012 Unique Job ID 55d42c9f592d7e45

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	T	R	R	Q	P	L	I	P	G	W	L	I	P	G	V	S	A	T	T	L	V	V	A	V	A	L	A	A	F	L	A	L	W	W	N	A	P	Q	D	D	W	V	A	V	W	Q	D	S	Y	L	W	H	V	V	R	F	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	Q	A	F	L	S	A	L	L	S	V	I	P	A	I	F	L	A	R	A	L	Y	R	R	R	F	P	G	R	L	A	L	L	R	L	C	A	M	T	L	I	L	P	V	L	V	A	V	F	G	I	L	S	V	Y	G	R	Q	G	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	T	L	C	Q	S	L	G	L	E	W	T	F	S	P	Y	G	L	Q	G	I	L	L	A	H	V	F	F	N	L	P	M	A	S	R	L	L	L	Q	A	L	E	N	I	P	G	E	Q	R	Q	L	A	A	Q	L	G	M	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	H	F	F	R	F	V	E	W	P	W	L	R	R	Q	I	P	P	V	A	A	L	I	F	M	L	C	F	A	S	F	A	T	V	L	S	L	G	G	G	P	Q	A	T	T	I	E	L	A	I	Y	Q	A	L	S	Y	D	Y	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	R	A	A	M	L	A	L	L	Q	M	V	C	C	L	G	L	V	L	L	S	Q	R	L	S	K	A	I	A	P	G	T	T	L	L	Q	G	W	R	D	P	D	D	R	L	H	S	R	I	C	D	T	V	L	I	V	L	A	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	L	L	P	P	L	L	A	V	I	V	D	G	V	N	R	Q	L	P	E	V	L	A	Q	P	V	L	W	Q	A	L	W	T	S	L	R	I	A	L	A	A	G	V	L	C	V	V	L	T	M	M	L	L	W	S	S	R	E	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?																																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	R	Q	K	M	L	A	G	Q	V	L	E	M	S	G	M	L	I	L	A	M	P	G	I	V	L	A	T	G	F	F	L	L	L	N	N	T	I	G	L	P	Q	S	A	D	G	I	V	I	F	T	N	A	L	M	A	I	P	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?															?	?																		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	K	V	L	E	N	P	M	R	D	I	T	A	R	Y	S	M	L	C	Q	S	L	G	I	E	G	W	S	R	L	K	V	V	E	L	R	A	L	K	R	P	L	A	Q	A	L	A	F	A	C	V	L	S	I	G	D	F	G	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	L	F	G	N	D	D	F	R	T	L	P	F	Y	L	Y	Q	Q	I	G	S	Y	R	S	Q	D	G	A	V	T	A	L	I	L	L	L	L	C	F	L	L	F	T	V	I	E	K	L	P	G	R	N	V	K	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?															?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand