Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45763 Date Thu Jan 5 12:03:40 GMT 2012 Unique Job ID 555d9c8126030af2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	E	S	L	M	V	I	R	S	S	S	T	L	R	K	H	W	E	W	M	T	F	S	A	D	S	V	S	S	V	H	T	L	T	D	D	L	P	L	E	S	L	A	D	Q	P	G	A	G	N	V	H	L	L	I	P	P	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																					?						?	?	?	?	?	?									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	L	Y	R	S	L	T	L	P	N	A	K	Y	K	L	T	A	Q	T	L	Q	W	L	A	E	E	T	L	P	D	N	T	Q	D	W	H	W	T	V	V	D	K	Q	N	E	S	V	E	V	I	G	I	Q	S	E	K	L	S	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	E	R	L	H	T	A	G	L	N	V	T	R	V	L	P	D	G	C	Y	L	P	W	E	V	D	S	W	T	L	V	N	Q	Q	T	S	W	L	I	R	S	A	A	H	A	F	N	E	L	D	E	H	W	L	Q	H	L	A	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	P	P	E	N	M	L	C	Y	G	V	V	P	H	G	V	A	A	A	N	P	L	I	Q	H	P	E	I	P	S	L	S	L	Y	S	A	D	I	A	F	Q	R	Y	D	M	L	H	G	I	F	R	K	Q	K	T	V	S	K	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	W	L	A	R	L	A	V	S	C	L	V	L	A	I	L	S	F	V	G	S	R	S	I	A	L	W	H	T	L	K	I	E	D	Q	L	Q	Q	Q	Q	Q	E	T	W	Q	R	Y	F	P	Q	I	K	R	T	H	N	F	R	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	K	Q	Q	L	A	Q	Q	Y	P	E	A	V	P	L	L	Y	H	L	Q	T	L	L	L	E	H	P	E	L	Q	L	M	E	A	N	Y	S	Q	K	Q	K	S	L	T	L	K	M	S	A	K	S	E	A	N	I	D	R	F	C	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?																?	?	?								?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	T	Q	S	W	L	P	M	E	K	T	E	K	D	P	V	S	G	V	W	T	V	R	N	S	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?					?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand