Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37177 Date Thu Jan 5 11:54:54 GMT 2012 Unique Job ID 5516dd95ae83d8b9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	T	R	L	R	E	I	V	E	K	V	A	S	A	P	R	L	N	E	A	L	N	I	L	V	T	D	I	C	L	A	M	D	T	E	V	C	S	V	Y	L	A	D	H	D	R	R	C	Y	Y	L	M	A	T	R	G	L	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	R	G	R	T	V	T	L	A	F	D	E	G	I	V	G	L	V	G	R	L	A	E	P	I	N	L	A	D	A	Q	K	H	P	S	F	K	Y	I	P	S	V	K	E	E	R	F	R	A	F	L	G	V	P	I	I	Q	R	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?			?																														?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	G	V	L	V	V	Q	Q	R	E	L	R	Q	Y	D	E	S	E	E	S	F	L	V	T	L	A	T	Q	M	A	A	I	L	S	Q	S	Q	L	T	A	L	F	G	Q	Y	R	Q	T	R	I	R	A	L	P	A	A	P	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	I	A	E	G	W	Q	D	A	T	L	P	L	M	E	Q	V	Y	Q	A	S	T	L	D	P	A	L	E	R	E	R	L	T	G	A	L	E	E	A	A	N	E	F	R	R	Y	S	K	R	F	A	A	G	A	Q	K	E	T	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	F	D	L	Y	S	H	L	L	S	D	T	R	L	R	R	E	L	F	A	E	V	D	K	G	S	V	A	E	W	A	V	K	T	V	I	E	K	F	A	E	Q	F	A	A	L	S	D	N	Y	L	K	E	R	A	G	D	L	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	G	Q	R	L	L	F	H	L	D	D	A	N	Q	G	P	N	A	W	P	E	R	F	I	L	V	A	D	E	L	S	A	T	T	L	A	E	L	P	Q	D	R	L	V	G	V	V	V	R	D	G	A	A	N	S	H	A	A	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	R	A	L	G	I	P	T	V	M	G	A	D	I	Q	P	S	V	L	H	R	R	T	L	I	V	D	G	Y	R	G	E	L	L	V	D	P	E	P	V	L	L	Q	E	Y	Q	R	L	I	S	E	E	I	E	L	S	R	L	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	D	V	N	L	P	A	Q	L	K	S	G	E	R	I	K	V	M	L	N	A	G	L	S	P	E	H	E	E	K	L	G	S	R	I	D	G	I	G	L	Y	R	T	E	I	P	F	M	L	Q	S	G	F	P	S	E	E	E	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	Q	Y	Q	G	M	L	Q	M	F	N	D	K	P	V	T	L	R	T	L	D	V	G	A	D	K	Q	L	P	Y	M	P	I	S	E	E	N	P	C	L	G	W	R	G	I	R	I	T	L	D	Q	P	E	I	F	L	I	Q	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	M	L	R	A	N	A	A	T	G	N	L	N	I	L	L	P	M	V	T	S	L	D	E	V	D	E	A	R	R	L	I	E	R	A	G	R	E	V	E	E	M	I	G	Y	E	I	P	K	P	R	I	G	I	M	L	E	V	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		M	V	F	M	L	P	H	L	A	K	R	V	D	F	I	S	V	G	T	N	D	L	T	Q	Y	I	L	A	V	D	R	N	N	T	R	V	A	N	I	Y	D	S	L	H	P	A	M	L	R	A	L	A	M	I	A	R	E	A	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		H	G	I	D	L	R	L	C	G	E	M	A	G	D	P	M	C	V	A	I	L	I	G	L	G	Y	R	H	L	S	M	N	G	R	S	V	A	R	A	K	Y	L	L	R	R	I	D	Y	A	E	A	E	N	L	A	Q	R	S	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	Q	L	A	T	E	V	R	H	Q	V	A	A	F	M	E	R	R	G	M	G	G	L	I	R	G	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand