Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABK9 Date Thu Jan 5 11:15:44 GMT 2012 Unique Job ID 54bd71ffca13f846

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	R	I	K	I	N	A	R	R	I	F	S	L	L	I	P	F	F	F	F	T	S	V	H	A	E	Q	T	A	A	P	A	K	P	V	T	V	E	A	K	N	E	T	F	A	P	Q	H	P	D	Q	Y	L	S	W	K	A	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	Q	S	E	R	V	D	A	L	A	E	D	P	R	L	V	I	L	W	A	G	Y	P	F	S	R	D	Y	N	K	P	R	G	H	A	F	A	V	T	D	V	R	E	T	L	R	T	G	A	P	K	N	A	E	D	G	P	L	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?	?																																						?		?	?	?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	C	W	S	C	K	S	P	D	V	A	R	L	I	Q	K	D	G	E	D	G	Y	F	H	G	K	W	A	R	G	G	P	E	I	V	N	N	L	G	C	A	D	C	H	N	T	A	S	P	E	F	A	K	G	K	P	E	L	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?			?				?	?	?	?													?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	R	P	Y	A	A	R	A	M	E	A	I	G	K	P	F	E	K	A	G	R	F	D	Q	Q	S	M	V	C	G	Q	C	H	V	E	Y	Y	F	D	G	K	N	K	A	V	K	F	P	W	D	D	G	M	K	V	E	N	M	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?				?							?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	Y	D	K	I	A	F	S	D	W	T	N	S	L	S	K	T	P	M	L	K	A	Q	H	P	E	Y	E	T	W	T	A	G	I	H	G	K	N	N	V	T	C	I	D	C	H	M	P	K	V	Q	N	A	E	G	K	L	Y	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?												?	?	?		?																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		H	K	I	G	N	P	F	D	N	F	A	Q	T	C	A	N	C	H	T	Q	D	K	A	A	L	Q	K	V	V	A	E	R	K	Q	S	I	N	D	L	K	I	K	V	E	D	Q	L	V	H	A	H	F	E	A	K	A	A	L	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	A	T	E	A	E	M	K	P	I	Q	D	D	I	R	H	A	Q	W	R	W	D	L	A	I	A	S	H	G	I	H	M	H	A	P	E	E	G	L	R	M	L	G	T	A	M	D	K	A	A	D	A	R	T	K	L	A	R	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	T	K	G	I	T	H	E	I	Q	I	P	D	I	S	T	K	E	K	A	Q	Q	A	I	G	L	N	M	E	Q	I	K	A	E	K	Q	D	F	I	K	T	V	I	P	Q	W	E	E	Q	A	R	K	N	G	L	L	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?			?								?		?		?	?	?					?		?		?																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand