Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P14377 Date Thu Jan 5 11:34:02 GMT 2012 Unique Job ID 52bd068126b9a06a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	F	M	Q	R	S	K	D	S	L	A	K	W	L	S	A	I	L	P	V	V	I	V	G	L	V	G	L	F	A	V	T	V	I	R	D	Y	G	R	A	S	E	A	D	R	Q	A	L	L	E	K	G	N	V	L	I	R	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	S	G	S	R	V	G	M	G	M	R	M	H	H	V	Q	Q	Q	A	L	L	E	E	M	A	G	Q	P	G	V	L	W	F	A	V	T	D	A	Q	G	I	I	I	L	H	S	D	P	D	K	V	G	R	A	L	Y	S	P	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	Q	K	L	K	P	E	E	N	S	R	W	R	L	L	G	K	T	E	T	T	P	A	L	E	V	Y	R	L	F	Q	P	M	S	A	P	W	R	H	G	M	H	N	M	P	R	C	N	G	K	A	V	P	Q	V	D	A	Q	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	F	I	A	V	D	A	S	D	L	V	A	T	Q	S	G	E	K	R	N	T	L	I	I	L	F	A	L	A	T	V	L	L	A	S	V	L	S	F	F	W	Y	R	R	Y	L	R	S	R	Q	L	L	Q	D	E	M	K	R	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	L	V	A	L	G	H	L	A	A	G	V	A	H	E	I	R	N	P	L	S	S	I	K	G	L	A	K	Y	F	A	E	R	A	P	A	G	G	E	A	H	Q	L	A	Q	V	M	A	K	E	A	D	R	L	N	R	V	V	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	L	E	L	V	K	P	T	H	L	A	L	Q	A	V	D	L	N	T	L	I	N	H	S	L	Q	L	V	S	Q	D	A	N	S	R	E	I	Q	L	R	F	T	A	N	D	T	L	P	E	I	Q	A	D	P	D	R	L	T	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	L	N	L	Y	L	N	A	I	Q	A	I	G	Q	H	G	V	I	S	V	T	A	S	E	S	G	A	G	V	K	I	S	V	T	D	S	G	K	G	I	A	A	D	Q	L	D	A	I	F	T	P	Y	F	T	T	K	A	E	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Sequence		G	L	G	L	A	V	V	H	N	I	V	E	Q	H	G	G	T	I	Q	V	A	S	Q	E	G	K	G	S	T	F	T	L	W	L	P	V	N	I	T	R	K	D	P	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand