Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24180 Date Thu Jan 5 11:40:57 GMT 2012 Unique Job ID 51f21460cd8cc030

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	K	H	A	R	F	F	L	L	P	S	F	I	L	I	S	A	A	L	I	A	G	C	N	D	K	G	E	E	K	A	H	V	G	E	P	Q	V	T	V	H	I	V	K	T	A	P	L	E	V	K	T	E	L	P	G	R	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?			?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	Y	R	I	A	E	V	R	P	Q	V	S	G	I	V	L	N	R	N	F	T	E	G	S	D	V	Q	A	G	Q	S	L	Y	Q	I	D	P	A	T	Y	Q	A	N	Y	D	S	A	K	G	E	L	A	K	S	E	A	A	A	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	H	L	T	V	K	R	Y	V	P	L	V	G	T	K	Y	I	S	Q	Q	E	Y	D	Q	A	I	A	D	A	R	Q	A	D	A	A	V	I	A	A	K	A	T	V	E	S	A	R	I	N	L	A	Y	T	K	V	T	A	P	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	R	I	G	K	S	T	V	T	E	G	A	L	V	T	N	G	Q	T	T	E	L	A	T	V	Q	Q	L	D	P	I	Y	V	D	V	T	Q	S	S	N	D	F	M	R	L	K	Q	S	V	E	Q	G	N	L	H	K	E	N	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?			?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	N	V	E	L	V	M	E	N	G	Q	T	Y	P	L	K	G	T	L	Q	F	S	D	V	T	V	D	E	S	T	G	S	I	T	L	R	A	V	F	P	N	P	Q	H	T	L	L	P	G	M	F	V	R	A	R	I	D	E	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?			?	?	?											?	?	?	?	?	?																													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	P	D	A	I	L	I	P	Q	Q	G	V	S	R	T	P	R	G	D	A	T	V	L	I	V	N	D	K	S	Q	V	E	A	R	P	V	V	A	S	Q	A	I	G	D	K	W	L	I	S	E	G	L	K	S	G	D	Q	V	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?										?	?																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Sequence		S	G	L	Q	K	A	R	P	G	E	Q	V	K	A	T	T	D	T	P	A	D	T	A	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand