Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37657 Date Thu Jan 5 11:56:30 GMT 2012 Unique Job ID 51df013406728e6c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	D	I	V	D	P	V	F	S	I	G	I	S	S	L	W	D	E	L	R	H	M	P	A	G	G	V	W	W	F	N	V	D	R	H	E	D	A	I	S	L	A	N	Q	T	I	A	S	Q	A	E	T	A	H	V	A	V	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?				?									?			?																											?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	D	S	D	P	A	K	I	F	Q	L	D	D	S	Q	G	P	E	K	I	K	L	F	S	M	L	N	H	E	K	G	L	Y	Y	L	T	R	D	L	Q	C	S	I	D	P	H	N	Y	L	F	I	L	V	C	A	N	N	A	W	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?	?															?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	I	P	A	E	R	L	R	S	W	L	D	K	M	N	K	W	S	R	L	N	H	C	S	L	L	V	I	N	P	G	N	N	N	D	K	Q	F	S	L	L	L	E	E	Y	R	S	L	F	G	L	A	S	L	R	F	Q	G	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		H	L	L	D	I	A	F	W	C	N	E	K	G	V	S	A	R	Q	Q	L	S	V	Q	Q	Q	N	G	I	W	T	L	V	Q	S	E	E	A	E	I	Q	P	R	S	D	E	K	R	I	L	S	N	V	A	V	L	E	G	A	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?														?			?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	S	E	H	W	Q	L	F	N	N	N	E	V	L	F	N	E	A	R	T	A	Q	A	A	T	V	V	F	S	L	Q	Q	N	A	Q	I	E	P	L	A	R	S	I	H	T	L	R	R	Q	R	G	S	A	M	K	I	L	V	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	T	A	S	L	R	A	T	D	E	R	L	L	L	A	C	G	A	N	M	V	I	P	W	N	A	P	L	S	R	C	L	T	M	I	E	S	V	Q	G	Q	K	F	S	R	Y	V	P	E	D	I	T	T	L	L	S	M	T	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?		?												?	?																			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	K	L	R	G	F	Q	K	W	D	V	F	C	N	A	V	N	N	M	M	N	N	P	L	L	P	A	H	G	K	G	V	L	V	A	L	R	P	V	P	G	I	R	V	E	Q	A	L	T	L	C	R	P	N	R	T	G	D	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	I	G	G	N	R	L	V	L	F	L	S	F	C	R	I	N	D	L	D	T	A	L	N	H	I	F	P	L	P	T	G	D	I	F	S	N	R	M	V	W	F	E	D	D	Q	I	S	A	E	L	V	Q	M	R	L	L	A	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Sequence		Q	W	G	M	P	L	P	L	T	Q	S	S	K	P	V	I	N	A	E	H	D	G	R	H	W	R	R	I	P	E	P	M	R	L	L	D	D	A	V	E	R	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand