Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76102 Date Thu Jan 5 12:18:56 GMT 2012 Unique Job ID 51d59b7b115df24d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	R	F	A	G	A	C	R	F	V	F	N	R	A	L	A	R	Q	N	E	N	H	E	A	G	N	K	Y	I	P	Y	G	K	M	A	S	W	L	V	E	W	K	N	A	T	E	T	Q	W	L	K	D	S	P	S	Q	P	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	S	L	K	D	L	E	R	A	Y	K	N	F	F	R	K	R	A	A	F	P	R	F	K	K	R	G	Q	N	D	A	F	R	Y	P	Q	G	V	K	L	D	Q	E	N	S	R	I	F	L	P	K	L	G	W	M	R	Y	R	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	Q	V	T	G	V	V	K	N	V	T	V	S	Q	S	C	G	K	W	Y	I	S	I	Q	T	E	S	E	V	S	T	P	V	H	P	S	A	S	M	V	G	L	D	A	G	V	A	K	L	A	T	L	S	D	G	T	V	F	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	N	S	F	Q	K	N	Q	K	K	L	A	R	L	Q	R	Q	L	S	R	K	V	K	F	S	N	N	W	Q	K	Q	K	R	K	I	Q	R	L	H	S	C	I	A	N	I	R	R	D	Y	L	H	K	V	T	T	A	V	S	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	A	M	I	V	I	E	D	L	K	V	S	N	M	S	K	S	A	A	G	T	V	S	Q	P	G	R	N	V	R	A	K	S	G	L	N	R	S	I	L	D	Q	G	W	Y	E	M	R	R	Q	L	A	Y	K	Q	L	W	R	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	V	L	A	V	P	P	A	Y	T	S	Q	R	C	A	Y	C	G	H	T	A	K	E	N	R	L	S	Q	S	K	F	R	C	Q	V	C	G	Y	T	A	N	A	D	V	N	G	A	R	N	I	L	A	A	G	H	A	V	L	A	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?		?	?																																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Sequence		G	E	M	V	Q	S	G	R	P	L	K	Q	E	P	T	E	M	I	Q	A	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand