Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A6T1 Date Thu Jan 5 11:03:51 GMT 2012 Unique Job ID 50f2ad0f9b3311de

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	N	I	N	P	T	Q	T	A	A	W	Q	A	L	Q	K	H	F	D	E	M	K	D	V	T	I	A	D	L	F	A	K	D	G	D	R	F	S	K	F	S	A	T	F	D	D	Q	M	L	V	D	Y	S	K	N	R	I	T	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	T	L	A	K	L	Q	D	L	A	K	E	C	D	L	A	G	A	I	K	S	M	F	S	G	E	K	I	N	R	T	E	N	R	A	V	L	H	V	A	L	R	N	R	S	N	T	P	I	L	V	D	G	K	D	V	M	P	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?																															?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	A	V	L	E	K	M	K	T	F	S	E	A	I	I	S	G	E	W	K	G	Y	T	G	K	A	I	T	D	V	V	N	I	G	I	G	G	S	D	L	G	P	Y	M	V	T	E	A	L	R	P	Y	K	N	H	L	N	M	H	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	S	N	V	D	G	T	H	I	A	E	V	L	K	K	V	N	P	E	T	T	L	F	L	V	A	S	K	T	F	T	T	Q	E	T	M	T	N	A	H	S	A	R	D	W	F	L	K	A	A	G	D	E	K	H	V	A	K	H	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
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Sequence		A	A	L	S	T	N	A	K	A	V	G	E	F	G	I	D	T	A	N	M	F	E	F	W	D	W	V	G	G	R	Y	S	L	W	S	A	I	G	L	S	I	V	L	S	I	G	F	D	N	F	V	E	L	L	S	G	A	H	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
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Sequence		D	K	H	F	S	T	T	P	A	E	K	N	L	P	V	L	L	A	L	I	G	I	W	Y	N	N	F	F	G	A	E	T	E	A	I	L	P	Y	D	Q	Y	M	H	R	F	A	A	Y	F	Q	Q	G	N	M	E	S	N	G	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	D	R	N	G	N	V	V	D	Y	Q	T	G	P	I	I	W	G	E	P	G	T	N	G	Q	H	A	F	Y	Q	L	I	H	Q	G	T	K	M	V	P	C	D	F	I	A	P	A	I	T	H	N	P	L	S	D	H	H	Q	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		L	S	N	F	F	A	Q	T	E	A	L	A	F	G	K	S	R	E	V	V	E	Q	E	Y	R	D	Q	G	K	D	P	A	T	L	D	Y	V	V	P	F	K	V	F	E	G	N	R	P	T	N	S	I	L	L	R	E	I	T	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		S	L	G	A	L	I	A	L	Y	E	H	K	I	F	T	Q	G	V	I	L	N	I	F	T	F	D	Q	W	G	V	E	L	G	K	Q	L	A	N	R	I	L	P	E	L	K	D	D	K	E	I	S	S	H	D	S	S	T	N	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	N	R	Y	K	A	W	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand