Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77552 Date Thu Jan 5 12:30:30 GMT 2012 Unique Job ID 50eb55ec3a0f2780

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	G	S	D	A	K	N	L	M	S	D	G	N	V	Q	I	V	K	T	G	E	V	I	G	A	T	Q	L	T	E	G	E	L	I	V	E	A	G	G	R	A	E	N	T	V	V	T	G	A	G	W	L	K	V	A	T	G	G	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?											?	?	?		?	?	?	?																															?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	C	T	Q	Y	G	N	N	G	T	L	S	V	S	D	G	A	I	A	T	D	I	V	Q	S	E	G	G	A	I	S	L	S	T	L	A	T	V	N	G	R	H	P	E	G	E	F	S	V	D	K	G	Y	A	C	G	L	L	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																	?	?	?															?		?					?	?	?				?	?			?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	G	G	N	L	R	V	L	E	G	H	R	A	E	K	I	I	L	D	Q	E	G	G	L	L	V	N	G	T	T	S	A	V	V	V	D	E	G	G	E	L	L	V	Y	P	G	G	E	A	S	N	C	E	I	N	Q	G	G	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?					?	?	?		?	?	?	?						?	?	?				?				?	?	?	?					?					?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	L	A	G	K	A	S	D	T	L	L	A	G	G	T	M	N	N	L	G	G	E	D	S	D	T	I	V	E	N	G	S	I	Y	R	L	G	T	D	G	L	Q	L	Y	S	S	G	K	T	Q	N	L	S	V	N	V	G	G	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?		?	?	?	?								?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	V	H	A	G	T	L	E	N	A	V	I	Q	G	G	T	V	I	L	L	S	P	T	S	A	D	E	N	F	V	V	E	E	D	R	A	P	V	E	L	T	G	S	V	A	L	L	D	G	A	S	M	I	I	G	Y	G	A	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?				?														?			?	?		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	Q	S	T	I	T	V	Q	Q	G	G	V	L	I	L	D	G	S	T	V	K	G	D	S	V	T	F	I	V	G	N	I	N	L	N	G	G	K	L	W	L	I	T	D	A	A	T	H	V	Q	L	K	V	K	R	L	R	G	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?											?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	I	C	L	Q	T	S	A	K	E	I	S	P	D	F	I	N	V	K	G	E	V	T	G	D	I	H	V	E	I	T	D	A	S	R	Q	T	L	C	N	A	L	K	L	Q	P	D	E	D	G	I	G	A	T	L	Q	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?																						?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand