Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37629 Date Thu Jan 5 11:56:02 GMT 2012 Unique Job ID 4f6c529bf07547cd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	A	I	D	N	Q	I	R	N	I	S	S	S	H	Q	D	K	H	S	D	K	V	N	S	H	Q	H	H	G	K	V	D	K	T	H	R	A	K	I	V	E	F	D	K	L	D	N	D	S	Q	I	D	N	D	F	G	L	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	Y	F	L	Q	H	G	H	W	K	V	N	D	R	S	H	Q	M	E	K	V	W	F	Y	N	S	E	P	S	I	D	I	Q	E	Y	N	R	F	A	D	N	T	T	D	T	F	I	F	T	I	I	P	D	N	N	H	V	L	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	S	P	I	T	V	T	V	E	C	K	G	G	Y	Y	F	I	N	S	S	G	D	K	S	D	I	I	Y	K	V	D	G	L	S	I	I	A	R	N	F	F	T	L	L	S	G	N	F	K	P	D	W	R	W	D	V	S	K	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	T	K	E	K	F	D	S	Y	V	K	S	V	F	S	K	I	D	F	Y	K	Q	C	G	V	I	N	P	Q	N	A	N	T	A	Y	F	G	D	T	D	G	R	V	G	A	V	L	Y	A	L	L	V	S	G	H	I	G	I	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	G	W	S	L	L	C	E	L	L	K	H	E	E	M	A	S	S	A	Y	K	H	K	N	N	K	V	L	Y	D	L	L	N	T	R	D	M	I	L	N	E	L	H	Q	H	V	F	L	K	D	D	A	I	T	P	C	I	F	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	H	T	G	D	R	F	S	T	I	F	G	D	K	Y	I	L	T	L	L	N	S	M	R	N	M	E	G	N	K	D	S	R	I	N	K	N	V	V	V	L	A	G	N	H	E	I	N	F	N	G	N	Y	T	A	R	L	A	N	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	L	S	A	G	D	T	Y	N	L	I	K	T	L	D	V	C	N	Y	D	S	E	R	Q	V	L	T	S	H	H	G	I	I	R	D	E	E	K	K	C	Y	C	L	G	A	L	Q	V	P	F	N	Q	M	K	N	P	T	D	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																														?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	L	A	N	I	F	N	K	K	H	K	E	H	M	D	D	P	L	F	H	L	I	R	S	N	T	L	K	P	T	P	V	Y	A	N	Y	F	D	N	T	T	D	F	R	P	A	R	E	R	I	F	I	C	G	E	T	L	K	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?								?	?	?		?	?	?																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
Sequence		D	P	S	K	Y	I	R	Q	K	Y	G	H	H	G	P	G	V	D	H	N	Q	Q	F	D	N	G	I	M	G	L	N	S	L	K	E	A	R	D	K	N	N	K	I	I	Y	S	S	G	L	S	C	F	Q	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?		?												?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand