Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52645 Date Thu Jan 5 12:05:58 GMT 2012 Unique Job ID 4de6e716f4db8da3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	G	K	Y	K	A	V	L	A	L	L	L	L	I	I	L	V	P	L	T	L	L	M	T	L	G	L	W	V	P	T	L	A	G	I	W	L	P	L	G	T	R	I	A	L	D	E	S	P	R	I	T	R	K	G	L	I	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																													?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	L	R	Y	L	V	G	D	C	Q	L	A	H	I	T	N	A	S	L	S	H	P	S	R	W	L	L	N	V	G	T	V	E	L	D	S	A	C	L	A	K	L	P	Q	T	E	Q	S	P	A	A	P	K	T	L	A	Q	W	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	L	P	N	T	W	I	N	I	D	K	L	I	F	S	P	W	Q	E	W	Q	G	K	L	S	L	A	L	T	S	D	I	Q	Q	L	R	Y	Q	G	E	K	V	K	F	Q	G	Q	L	K	G	Q	Q	L	T	V	S	E	L	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?								?	?	?			?	?		?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	A	F	E	N	Q	P	P	V	K	L	V	G	E	F	A	M	P	L	V	P	D	G	L	P	V	S	G	H	A	T	A	T	L	N	L	P	Q	E	P	S	L	V	D	A	E	L	D	W	Q	E	N	S	G	Q	L	I	V	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?		?																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	D	N	G	D	P	L	L	D	L	P	W	Q	I	T	R	Q	Q	L	T	V	S	D	G	R	W	S	W	P	Y	A	G	F	P	L	S	G	R	L	G	V	K	V	D	N	W	Q	A	G	L	E	N	A	L	V	S	G	R	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?											?	?								?				?		?		?	?	?												?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	L	T	Q	G	Q	A	G	K	G	N	A	V	L	N	F	G	P	G	K	L	S	M	D	N	S	Q	L	P	L	Q	L	T	G	E	A	K	Q	A	D	L	I	L	Y	A	R	L	P	A	Q	L	S	G	S	L	S	D	P	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?			?							?	?	?	?		?	?	?	?	?															?					?	?	?						?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	F	E	P	G	A	L	L	R	S	K	G	R	V	I	D	S	L	D	I	D	E	I	R	W	P	L	A	G	V	K	V	T	Q	R	G	V	D	G	R	L	Q	A	I	L	Q	A	H	E	N	E	L	G	D	F	V	L	H	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	L	A	N	D	F	L	P	D	A	G	R	W	Q	W	R	Y	W	G	K	G	S	F	T	P	M	N	A	T	W	D	V	A	G	K	G	E	W	H	D	S	T	I	T	L	T	D	L	S	T	G	F	D	Q	L	Q	Y	G	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?				?		?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	V	E	K	P	R	L	I	L	D	K	P	I	V	W	V	R	D	A	Q	H	P	S	F	S	G	A	L	S	L	D	A	G	Q	T	L	F	T	G	G	S	V	L	P	P	S	T	L	K	F	S	V	D	G	R	D	P	T	Y	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?	?	?	?	?	?			?	?					?	?	?	?	?	?	?	?							?		?			?		?	?				?	?	?	?					?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	F	K	G	D	L	H	A	G	E	I	G	P	V	R	V	N	G	R	W	D	G	I	R	L	R	G	N	A	W	W	P	K	Q	S	L	T	V	F	Q	P	L	V	P	P	D	W	K	M	N	L	R	D	G	E	L	Y	A	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?		?	?			?		?		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	F	S	A	A	P	E	Q	G	F	R	A	G	G	H	G	V	L	K	G	G	S	A	W	M	P	D	N	Q	V	N	G	V	D	F	V	L	P	F	R	F	A	D	G	A	W	H	L	G	T	R	G	P	V	T	L	R	I	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?		?	?	?	?										?	?		?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	I	N	L	V	T	A	K	N	I	T	A	D	L	Q	G	R	Y	P	W	T	E	E	E	P	L	L	L	T	D	V	S	V	D	V	L	G	G	N	V	L	M	K	Q	L	R	M	P	Q	H	D	P	A	L	L	R	L	N	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?					?																																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		S	S	S	E	L	V	S	A	V	N	P	K	Q	F	A	M	S	G	A	F	S	G	A	L	P	L	W	L	N	N	E	K	W	I	V	K	D	G	W	L	A	N	S	G	P	M	T	L	R	L	D	K	D	T	A	D	A	V	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?						?	?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		D	N	M	T	A	G	S	A	I	N	W	L	R	Y	M	E	I	S	R	S	S	T	K	I	N	L	D	N	L	G	L	L	T	M	Q	A	N	I	T	G	T	S	R	V	D	G	K	S	G	T	V	N	L	N	Y	H	H	E	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																							?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	F	T	L	W	R	S	L	R	F	G	D	N	L	Q	A	W	L	E	Q	N	A	R	L	P	G	N	D	C	P	Q	G	K	E	C	E	E	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?			?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence