Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P29744 Date Thu Jan 5 11:45:40 GMT 2012 Unique Job ID 4c3a3a93aa9dada0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	F	S	T	Q	M	M	Y	Q	Q	N	M	R	G	I	T	N	S	Q	A	E	W	M	K	Y	G	E	Q	M	S	T	G	K	R	V	V	N	P	S	D	D	P	I	A	A	S	Q	A	V	V	L	S	Q	A	Q	A	Q	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	Y	T	L	A	R	T	F	A	T	Q	K	V	S	L	E	E	S	V	L	S	Q	V	T	T	A	I	Q	N	A	Q	E	K	I	V	Y	A	S	N	G	T	L	S	D	D	D	R	A	S	L	A	T	D	I	Q	G	L	R	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	N	L	A	N	T	T	D	G	N	G	R	Y	I	F	A	G	Y	K	T	E	T	A	P	F	S	E	E	K	G	K	Y	V	G	G	A	E	S	I	K	Q	Q	V	D	A	S	R	S	M	V	I	G	H	T	G	D	K	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?		?									?	?	?				?	?					?	?												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	S	I	T	S	N	A	V	A	E	P	D	G	S	A	S	E	T	N	L	F	A	M	L	D	S	A	I	A	A	L	K	T	P	V	A	D	S	E	A	D	K	E	T	A	A	A	A	L	D	K	T	N	R	G	L	K	N	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?			?	?	?		?	?	?	?				?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	N	V	L	T	V	R	A	E	L	G	T	Q	L	N	E	L	E	S	L	D	S	L	G	S	D	R	A	L	G	Q	T	Q	Q	M	S	D	L	V	D	V	D	W	N	A	T	I	S	S	Y	I	M	Q	Q	T	A	L	Q	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	K	A	F	T	D	M	Q	G	L	S	L	F	Q	L	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?					?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand