Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFA5 Date Thu Jan 5 11:25:44 GMT 2012 Unique Job ID 4bf3303cb26f4f03

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	W	L	L	D	V	F	A	T	W	L	Y	G	L	K	V	I	A	I	T	L	A	V	I	M	F	I	S	G	L	D	D	F	F	I	D	V	V	Y	W	V	R	R	I	K	R	K	L	S	V	Y	R	R	Y	P	R	M	S	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	E	L	Y	K	P	D	E	K	P	L	A	I	M	V	P	A	W	N	E	T	G	V	I	G	N	M	A	E	L	A	A	T	T	L	D	Y	E	N	Y	H	I	F	V	G	T	Y	P	N	D	P	D	T	Q	R	D	V	D	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		C	A	R	F	P	N	V	H	K	V	V	C	A	R	P	G	P	T	S	K	A	D	C	L	N	N	V	L	D	A	I	T	Q	F	E	R	S	A	N	F	A	F	A	G	F	I	L	H	D	A	E	D	V	I	S	P	M	E	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	F	N	Y	L	V	E	R	K	D	L	I	Q	I	P	V	Y	P	F	E	R	E	W	T	H	F	T	S	M	T	Y	I	D	E	F	S	E	L	H	G	K	D	V	P	V	R	E	A	L	A	G	Q	V	P	S	A	G	V	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		C	F	S	R	R	A	V	T	A	L	L	A	D	G	D	G	I	A	F	D	V	Q	S	L	T	E	D	Y	D	I	G	F	R	L	K	E	K	G	M	T	E	I	F	V	R	F	P	V	V	D	E	A	K	E	R	E	Q	R	K	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?																																						?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	Q	H	A	R	T	S	N	M	I	C	V	R	E	Y	F	P	D	T	F	S	T	A	V	R	Q	K	S	R	W	I	I	G	I	V	F	Q	G	F	K	T	H	K	W	T	S	S	L	T	L	N	Y	F	L	W	R	D	R	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																			?	?	?	?	?		?	?	?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	I	S	N	F	V	S	F	L	A	M	L	V	M	I	Q	L	L	L	L	L	A	Y	E	S	L	W	P	D	A	W	H	F	L	S	I	F	S	G	S	A	W	L	M	T	L	L	W	L	N	F	G	L	M	V	N	R	I	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	V	I	F	V	T	G	Y	Y	G	L	T	Q	G	L	L	S	V	L	R	L	F	W	G	N	L	I	N	F	M	A	N	W	R	A	L	K	Q	V	L	Q	H	G	D	P	R	R	V	A	W	D	K	T	T	H	D	F	P	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	G	D	T	R	S	L	R	P	L	G	Q	I	L	L	E	N	Q	V	I	T	E	E	Q	L	D	T	A	L	R	N	R	V	E	G	L	R	L	G	G	S	M	L	M	Q	G	L	I	S	A	E	Q	L	A	Q	A	L	A	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		N	G	V	A	W	E	S	I	D	A	W	Q	I	P	S	S	L	I	A	E	M	P	A	S	V	A	L	H	Y	A	V	L	P	L	R	L	E	N	D	E	L	I	V	G	S	E	D	G	I	D	P	V	S	L	A	A	L	T	R	K
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		V	G	R	K	V	R	Y	V	I	V	L	R	G	Q	I	V	T	G	L	R	H	W	Y	A	R	R	R	G	H	D	P	R	A	M	L	Y	N	A	V	Q	H	Q	W	L	T	E	Q	Q	A	G	E	I	W	R	Q	Y	V	P	H	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		F	L	F	A	E	I	L	T	T	L	G	H	I	N	R	S	A	I	N	V	L	L	L	R	H	E	R	S	S	L	P	L	G	K	F	L	V	T	E	G	V	I	S	Q	E	T	L	D	R	V	L	T	I	Q	R	E	L	Q	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?																					?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.
Sequence		M	Q	S	L	L	L	K	A	G	L	N	T	E	Q	V	A	Q	L	E	S	E	N	E	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand