Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39276 Date Thu Jan 5 11:58:45 GMT 2012 Unique Job ID 4b96d7f1abb954c0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	P	S	Q	P	R	A	I	Y	Y	I	V	A	I	Q	I	W	E	Y	F	S	F	Y	G	M	R	A	L	L	I	L	Y	L	T	H	Q	L	G	F	D	D	N	H	A	I	S	L	F	S	A	Y	A	S	L	V	Y	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	I	L	G	G	W	L	A	D	R	L	L	G	N	R	T	A	V	I	A	G	A	L	L	M	T	L	G	H	V	V	L	G	I	D	T	N	S	T	F	S	L	Y	L	A	L	A	I	I	I	C	G	Y	G	L	F	K	S	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	C	L	L	G	E	L	Y	D	E	N	D	H	R	R	D	G	G	F	S	L	L	Y	A	A	G	N	I	G	S	I	A	A	P	I	A	C	G	L	A	A	Q	W	Y	G	W	H	V	G	F	A	L	A	G	G	G	M	F	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	L	I	F	L	S	G	H	R	H	F	Q	S	T	R	S	M	D	K	K	A	L	T	S	V	K	F	A	L	P	V	W	S	W	L	V	V	M	L	C	L	A	P	V	F	F	T	L	L	L	E	N	D	W	S	G	Y	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	V	C	L	I	A	A	Q	I	I	A	R	M	M	I	K	F	P	E	H	R	R	A	L	W	Q	I	V	L	L	M	F	V	G	T	L	F	W	V	L	A	Q	Q	G	G	S	T	I	S	L	F	I	D	R	F	V	N	R	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	N	I	E	V	P	T	A	L	F	Q	S	V	N	A	I	A	V	M	L	A	G	V	V	L	A	W	L	A	S	P	E	S	R	G	N	S	T	L	R	V	W	L	K	F	A	F	G	L	L	L	M	A	C	G	F	M	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	D	A	R	H	A	A	A	D	G	Q	A	S	M	G	V	M	I	S	G	L	A	L	M	G	F	A	E	L	F	I	D	P	V	A	I	A	Q	I	T	R	L	K	M	S	G	V	L	T	G	I	Y	M	L	A	T	G	A	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?																																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		N	W	L	A	G	V	V	A	Q	Q	T	T	E	S	Q	I	S	G	M	A	I	A	A	Y	Q	R	F	F	S	Q	M	G	E	W	T	L	A	C	V	A	I	I	V	V	L	A	F	A	T	R	F	L	F	S	T	P	T	N	M	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		Q	E	S	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand