Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P42604 Date Thu Jan 5 12:01:48 GMT 2012 Unique Job ID 4ad8af1865813e3b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	Y	I	K	I	H	A	L	D	N	V	A	V	A	L	A	D	L	A	E	G	T	E	V	S	V	D	N	Q	T	V	T	L	R	Q	D	V	A	R	G	H	K	F	A	L	T	D	I	A	K	G	A	N	V	I	K	Y	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	I	G	Y	A	L	A	D	I	A	A	G	V	H	V	H	A	H	N	T	R	T	N	L	S	D	L	D	Q	Y	R	Y	Q	P	D	F	Q	D	L	P	A	Q	A	A	D	R	E	V	Q	I	Y	R	R	A	N	G	D	V	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?		?	?	?	?	?	?	?		?				?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	N	E	L	W	I	L	P	T	V	G	C	V	N	G	I	A	R	Q	I	Q	N	R	F	L	K	E	T	N	N	A	E	G	T	D	G	V	F	L	F	S	H	T	Y	G	C	S	Q	L	G	D	D	H	I	N	T	R	T	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	N	M	V	R	H	P	N	A	G	A	V	L	V	I	G	L	G	C	E	N	N	Q	V	A	A	F	R	E	T	L	G	D	I	D	P	E	R	V	H	F	M	I	C	Q	Q	Q	D	D	E	I	E	A	G	I	E	H	L	H	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	Y	N	V	M	R	N	D	K	R	E	P	G	K	L	S	E	L	K	F	G	L	E	C	G	G	S	D	G	L	S	G	I	T	A	N	P	M	L	G	R	F	S	D	Y	V	I	A	N	G	G	T	T	V	L	T	E	V	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	F	G	A	E	Q	L	L	M	D	H	C	R	D	E	A	T	F	E	K	L	V	T	M	V	N	D	F	K	Q	Y	F	I	A	H	D	Q	P	I	Y	E	N	P	S	P	G	N	K	A	G	G	I	T	T	L	E	D	K	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	C	T	Q	K	A	G	S	S	V	V	V	D	V	L	R	Y	G	E	R	L	K	T	P	G	L	N	L	L	S	A	P	G	N	D	A	V	A	T	S	A	L	A	G	A	G	C	H	M	V	L	F	S	T	G	R	G	T	P	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	G	F	V	P	T	V	K	I	A	T	N	S	E	L	A	A	K	K	K	H	W	I	D	F	D	A	G	Q	L	I	H	G	K	A	M	P	Q	L	L	E	E	F	I	D	T	I	V	E	F	A	N	G	K	Q	T	C	N	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Sequence		N	D	F	R	E	L	A	I	F	K	S	G	V	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand