Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32705 Date Thu Jan 5 11:50:26 GMT 2012 Unique Job ID 4a2db867fff94ccf

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	V	L	T	A	L	A	A	T	L	P	F	A	A	N	A	A	D	A	I	S	G	A	V	E	R	Q	P	T	N	W	Q	A	I	I	M	F	L	I	F	V	V	F	T	L	G	I	T	Y	W	A	S	K	R	V	R	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?												?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	D	Y	Y	T	A	G	G	N	I	T	G	F	Q	N	G	L	A	I	A	G	D	Y	M	S	A	A	S	F	L	G	I	S	A	L	V	F	T	S	G	Y	D	G	L	I	Y	S	L	G	F	L	V	G	W	P	I	I	L	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	A	E	R	L	R	N	L	G	R	Y	T	F	A	D	V	A	S	Y	R	L	K	Q	G	P	I	R	I	L	S	A	C	G	S	L	V	V	V	A	L	Y	L	I	A	Q	M	V	G	A	G	K	L	I	E	L	L	F	G	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	H	I	A	V	V	L	V	G	V	L	M	M	M	Y	V	L	F	G	G	M	L	A	T	T	W	V	Q	I	I	K	A	V	L	L	L	F	G	A	S	F	M	A	F	M	V	M	K	H	V	G	F	S	F	N	N	L	F	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	M	A	V	H	P	K	G	V	D	I	M	K	P	G	G	L	V	K	D	P	I	S	A	L	S	L	G	L	G	L	M	F	G	T	A	G	L	P	H	I	L	M	R	F	F	T	V	S	D	A	R	E	A	R	K	S	V	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	T	G	F	M	G	Y	F	Y	I	L	T	F	I	I	G	F	G	A	I	M	L	V	G	A	N	P	E	Y	K	D	A	A	G	H	L	I	G	G	N	N	M	A	A	V	H	L	A	N	A	V	G	G	N	L	F	L	G	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	A	V	A	F	A	T	I	L	A	V	V	A	G	L	T	L	A	G	A	S	A	V	S	H	D	L	Y	A	N	V	F	K	K	G	A	T	E	R	E	E	L	R	V	S	K	I	T	V	L	I	L	G	V	I	A	I	I	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	L	F	E	N	Q	N	I	A	F	M	V	G	L	A	F	A	I	A	A	S	C	N	F	P	I	I	L	L	S	M	Y	W	S	K	L	T	T	R	G	A	M	M	G	G	W	L	G	L	I	T	A	V	V	L	M	I	L	G	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	I	W	V	Q	I	L	G	H	E	K	A	I	F	P	Y	E	Y	P	A	L	F	S	I	T	V	A	F	L	G	I	W	F	F	S	A	T	D	N	S	A	E	G	A	R	E	R	E	L	F	R	A	Q	F	I	R	S	Q	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																														?	?	?		?	?	?	?													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	G	V	E	Q	G	R	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand