Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P13029 Date Thu Jan 5 11:33:28 GMT 2012 Unique Job ID 490a18cce7b3087c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	T	S	D	D	I	H	N	T	T	A	T	G	K	C	P	F	H	Q	G	G	H	D	Q	S	A	G	A	G	T	T	T	R	D	W	W	P	N	Q	L	R	V	D	L	L	N	Q	H	S	N	R	S	N	P	L	G	E	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?					?		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	Y	R	K	E	F	S	K	L	D	Y	Y	G	L	K	K	D	L	K	A	L	L	T	E	S	Q	P	W	W	P	A	D	W	G	S	Y	A	G	L	F	I	R	M	A	W	H	G	A	G	T	Y	R	S	I	D	G	R	G	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?			?																							?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	R	G	Q	Q	R	F	A	P	L	N	S	W	P	D	N	V	S	L	D	K	A	R	R	L	L	W	P	I	K	Q	K	Y	G	Q	K	I	S	W	A	D	L	F	I	L	A	G	N	V	A	L	E	N	S	G	F	R	T	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	G	A	G	R	E	D	V	W	E	P	D	L	D	V	N	W	G	D	E	K	A	W	L	T	H	R	H	P	E	A	L	A	K	A	P	L	G	A	T	E	M	G	L	I	Y	V	N	P	E	G	P	D	H	S	G	E	P	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	A	A	A	I	R	A	T	F	G	N	M	G	M	N	D	E	E	T	V	A	L	I	A	G	G	H	T	L	G	K	T	H	G	A	G	P	T	S	N	V	G	P	D	P	E	A	A	P	I	E	E	Q	G	L	G	W	A	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		Y	G	S	G	V	G	A	D	A	I	T	S	G	L	E	V	V	W	T	Q	T	P	T	Q	W	S	N	Y	F	F	E	N	L	F	K	Y	E	W	V	Q	T	R	S	P	A	G	A	I	Q	F	E	A	V	D	A	P	E	I	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?	?	?			?	?				?	?	?		?																	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?						?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
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Sequence		D	P	F	D	P	S	K	K	R	K	P	T	M	L	V	T	D	L	T	L	R	F	D	P	E	F	E	K	I	S	R	R	F	L	N	D	P	Q	A	F	N	E	A	F	A	R	A	W	F	K	L	T	H	R	D	M	G	P	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																												?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	Y	I	G	P	E	V	P	K	E	D	L	I	W	Q	D	P	L	P	Q	P	I	Y	N	P	T	E	Q	D	I	I	D	L	K	F	A	I	A	D	S	G	L	S	V	S	E	L	V	S	V	A	W	A	S	A	S	T	F	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?										?	?	?				?	?	?																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	D	K	R	G	G	A	N	G	A	R	L	A	L	M	P	Q	R	D	W	D	V	N	A	A	A	V	R	A	L	P	V	L	E	K	I	Q	K	E	S	G	K	A	S	L	A	D	I	I	V	L	A	G	V	V	G	V	E	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?		?							?			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	S	A	A	G	L	S	I	H	V	P	F	A	P	G	R	V	D	A	R	Q	D	Q	T	D	I	E	M	F	E	L	L	E	P	I	A	D	G	F	R	N	Y	R	A	R	L	D	V	S	T	T	E	S	L	L	I	D	K	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		Q	L	T	L	T	A	P	E	M	T	A	L	V	G	G	M	R	V	L	G	A	N	F	D	G	S	K	N	G	V	F	T	D	R	V	G	V	L	S	N	D	F	F	V	N	L	L	D	M	R	Y	E	W	K	A	T	D	E	S	K
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	L	F	E	G	R	D	R	E	T	G	E	V	K	F	T	A	S	R	A	D	L	V	F	G	S	N	S	V	L	R	A	V	A	E	V	Y	A	S	S	D	A	H	E	K	F	V	K	D	F	V	A	A	W	V	K	V	M	N	L
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		D	R	F	D	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand