Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q9S4W2 Date Thu Jan 5 12:38:17 GMT 2012 Unique Job ID 47edf7051528af1b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	V	T	E	S	K	A	K	T	E	R	K	S	S	R	K	P	A	K	T	Q	E	T	V	L	S	A	L	L	A	Q	T	E	E	V	S	V	P	L	A	S	L	I	K	S	P	L	N	V	R	T	V	P	Y	S	A	E	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	E	L	A	D	S	I	K	G	V	G	L	L	Q	N	L	V	V	H	A	L	P	G	D	R	Y	G	V	A	A	G	G	R	R	L	A	A	L	N	M	L	A	E	R	D	I	I	Q	V	D	W	P	V	R	V	K	V	I	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	L	A	T	A	A	S	M	T	E	N	G	H	R	R	D	M	H	P	A	E	Q	I	A	G	F	R	A	M	A	Q	E	G	K	T	P	A	Q	I	G	D	L	L	G	Y	S	P	R	H	V	Q	R	M	L	K	L	A	D	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	V	I	L	D	A	L	A	E	D	R	I	T	T	E	H	C	Q	A	L	A	L	E	N	D	T	A	R	Q	V	Q	V	F	E	A	A	C	Q	S	G	W	G	G	K	P	D	V	R	V	I	R	N	L	I	T	E	S	E	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?																												?	?	?	?													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	K	D	N	T	K	F	R	F	V	G	A	D	A	F	S	P	D	E	L	R	T	D	L	F	S	D	D	E	G	G	Y	V	D	C	V	A	L	D	A	A	L	L	E	K	L	Q	A	V	A	E	H	L	R	E	A	E	G	W	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		W	C	A	G	R	M	E	P	V	G	E	C	R	E	D	S	R	A	Y	R	N	L	P	E	P	E	A	V	L	T	E	A	E	E	E	R	L	N	E	L	M	M	R	Y	D	A	L	E	N	Q	C	E	E	S	D	L	L	A	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?			?	?																					?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	K	L	I	D	C	M	A	K	V	R	A	W	T	P	E	M	R	A	G	S	G	V	V	V	S	W	R	Y	G	N	V	C	V	Q	R	G	V	Q	L	R	S	E	D	D	V	T	D	D	A	D	R	T	E	Q	V	Q	E	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?		?																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	V	E	E	I	S	L	P	L	L	T	K	M	S	S	E	R	T	L	A	V	Q	A	A	L	M	Q	Q	P	D	K	S	L	A	L	L	T	W	T	L	C	L	N	V	F	G	S	G	A	Y	S	K	P	A	Q	I	S	L	E	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		K	H	Y	S	L	T	S	D	A	P	S	G	K	E	G	A	A	F	M	A	L	M	A	E	K	A	R	L	V	V	L	L	P	E	G	W	S	R	D	M	T	T	F	L	S	L	S	Q	E	V	L	L	S	L	L	S	F	C	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		C	S	I	H	G	V	Q	T	R	E	C	G	H	T	S	R	S	P	L	D	P	L	E	T	A	I	G	F	H	M	R	D	W	W	Q	P	T	K	A	N	F	F	G	H	L	K	K	P	Q	I	I	A	A	L	N	E	A	G	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
Sequence		G	A	A	R	D	A	E	K	M	K	K	G	D	A	A	E	H	A	E	F	H	M	K	D	N	R	W	V	P	G	W	M	C	A	P	R	P	Q	T	D	A	T	E	R	T	D	N	L	A	D	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?					?	?	?																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand