Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16916 Date Wed Jan 25 15:20:39 GMT 2012 Unique Job ID 47ca9e2d682e1b9a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	G	K	P	A	A	R	Q	G	D	M	T	Q	Y	G	G	S	I	V	Q	G	S	A	G	V	R	I	G	A	P	T	G	V	A	C	S	V	C	P	G	G	V	T	S	G	H	P	V	N	P	L	L	G	A	K	V	L	P	G
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?		?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	T	D	I	A	L	P	G	P	L	P	F	I	L	S	R	T	Y	S	S	Y	R	T	K	T	P	A	P	V	G	S	L	G	P	G	W	K	M	P	A	D	I	R	L	Q	L	R	D	N	T	L	I	L	S	D	N	G	G	R	S
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Disorder																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	Y	F	E	H	L	F	P	G	E	D	G	Y	S	R	S	E	S	L	W	L	V	R	G	G	V	A	K	L	D	E	G	H	R	L	A	A	L	W	Q	A	L	P	E	E	L	R	L	S	P	H	R	Y	L	A	T	N	S	P	Q
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	P	W	W	L	L	G	W	C	E	R	V	P	E	A	D	E	V	L	P	A	P	L	P	P	Y	R	V	L	T	G	L	V	D	R	F	G	R	T	Q	T	F	H	R	E	A	A	G	E	F	S	G	E	I	T	G	V	T	D	G
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	W	R	H	F	R	L	V	L	T	T	Q	A	Q	R	A	E	E	A	R	Q	Q	A	I	S	G	G	T	E	P	S	A	F	P	D	T	L	P	G	Y	T	E	Y	G	R	D	N	G	I	R	L	S	A	V	W	L	T	H	D	P
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	Y	P	E	N	L	P	A	A	P	L	V	R	Y	G	W	T	P	R	G	E	L	A	V	V	Y	D	R	S	G	K	Q	V	R	S	F	T	Y	D	D	K	Y	R	G	R	M	V	A	H	R	H	T	G	R	P	E	I	R	Y	R
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	D	S	D	G	R	V	T	E	Q	L	N	P	A	G	L	S	Y	T	Y	Q	Y	E	K	D	R	I	T	I	T	D	S	L	D	R	R	E	V	L	H	T	Q	G	E	A	G	L	K	R	V	V	K	K	E	H	A	D	G	S	V
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Disorder
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Sequence		T	Q	S	Q	F	D	A	V	G	R	L	R	A	Q	T	D	A	A	G	R	T	T	E	Y	S	P	D	V	V	T	G	L	I	T	R	I	T	T	P	D	G	R	A	S	A	F	Y	Y	N	H	H	N	Q	L	T	S	A	T	G	P
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Disorder
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Sequence		D	G	L	E	L	R	R	E	Y	D	E	L	G	R	L	I	Q	E	T	A	P	D	G	D	I	T	R	Y	R	Y	D	N	P	H	S	D	L	P	C	A	T	E	D	A	T	G	S	R	K	T	M	T	W	S	R	Y	G	Q	L	L
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	F	T	D	C	S	G	Y	V	T	R	Y	D	H	D	R	F	G	Q	M	T	A	V	H	R	E	E	G	L	S	Q	Y	R	A	Y	D	S	R	G	Q	L	I	A	V	K	D	T	Q	G	H	E	T	R	Y	E	Y	N	I	A	G
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		D	L	T	A	V	I	A	P	D	G	S	R	N	G	T	Q	Y	D	A	W	G	K	A	V	R	T	T	Q	G	G	L	T	R	S	M	E	Y	D	A	A	G	R	V	I	R	L	T	S	E	N	G	S	H	T	T	F	R	Y	D	V
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		L	D	R	L	I	Q	E	T	G	F	D	G	R	T	Q	R	Y	H	H	D	L	T	G	K	L	I	R	S	E	D	E	G	L	V	T	H	W	H	Y	D	E	A	D	R	L	T	H	R	T	V	K	G	E	T	A	E	R	W	Q	Y
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		D	E	R	G	W	L	T	D	I	S	H	I	S	E	G	H	R	V	A	V	H	Y	R	Y	D	E	K	G	R	L	T	G	E	R	Q	T	V	H	H	P	Q	T	E	A	L	L	W	Q	H	E	T	R	H	A	Y	N	A	Q	G	L
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Disorder													?																								?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		A	N	R	C	I	P	D	S	L	P	A	V	E	W	L	T	Y	G	S	G	Y	L	A	G	M	K	L	G	D	T	P	L	V	E	Y	T	R	D	R	L	H	R	E	T	L	R	S	F	G	R	Y	E	L	T	T	A	Y	T	P	A
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Disorder								?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		G	Q	L	Q	S	Q	H	L	N	S	L	L	S	D	R	D	Y	T	W	N	D	N	G	E	L	I	R	I	S	S	P	R	Q	T	R	S	Y	S	Y	S	T	T	G	R	L	T	G	V	H	T	T	A	A	N	L	D	I	R	I	P
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SS confidence
Disorder										?	?	?																				?																				?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		Y	A	T	D	P	A	G	N	R	L	P	D	P	E	L	H	P	D	S	T	L	S	M	W	P	D	N	R	I	A	R	D	A	H	Y	L	Y	R	Y	D	R	H	G	R	L	T	E	K	T	D	L	I	P	E	G	V	I	R	T	D
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		D	E	R	T	H	R	Y	H	Y	D	S	Q	H	R	L	V	H	Y	T	R	T	Q	Y	E	E	P	L	V	E	S	R	Y	L	Y	D	P	L	G	R	R	V	A	K	R	V	W	R	R	E	R	D	L	T	G	W	M	S	L	S	R
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SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		K	P	Q	V	T	W	Y	G	W	D	G	D	R	L	T	T	I	Q	N	D	R	T	R	I	Q	T	I	Y	Q	P	G	S	F	T	P	L	I	R	V	E	T	A	T	G	E	L	A	K	T	Q	R	R	S	L	A	D	A	L	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		S	G	G	E	D	G	G	S	V	V	F	P	P	V	L	V	Q	M	L	D	R	L	E	S	E	I	L	A	D	R	V	S	E	E	S	R	R	W	L	A	S	C	G	L	T	V	E	Q	M	Q	N	Q	M	D	P	V	Y	T	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		R	K	I	H	L	Y	H	C	D	H	R	G	L	P	L	A	L	I	S	K	E	G	T	T	E	W	C	A	E	Y	D	E	W	G	N	L	L	N	E	E	N	P	H	Q	L	Q	Q	L	I	R	L	P	G	Q	Q	Y	D	E	E	S
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SS confidence
Disorder																																								?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		G	L	Y	Y	N	R	H	R	Y	Y	D	P	L	Q	G	R	Y	I	T	Q	D	P	I	G	L	K	G	G	W	N	F	Y	Q	Y	P	L	N	P	V	T	N	T	D	P	L	G	L	E	V	F	P	R	P	F	P	L	P	I	P	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		P	K	S	P	A	Q	Q	Q	A	D	D	N	A	A	K	A	L	T	K	W	W	N	D	T	A	S	Q	R	I	F	D	S	L	I	L	N	N	P	G	L	A	L	D	I	T	M	I	A	S	R	G	N	V	A	D	T	G	I	T	D
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Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		R	V	N	D	I	I	N	D	R	F	W	S	D	G	K	K	P	D	R	C	D	V	L	Q	E	L	I	D	C	G	D	I	S	A	K	D	A	K	S	T	Q	K	A	W	N	C	R	H	S	R	Q	S	N	D	K	K	R
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Disorder											?	?	?	?	?	?		?											?	?	?	?			?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?
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