Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P25549 Date Thu Jan 5 11:42:06 GMT 2012 Unique Job ID 4748a1f0d18c62f9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	F	S	F	S	P	K	R	L	V	V	A	V	A	A	A	L	P	L	M	A	S	A	A	D	T	P	S	T	A	T	A	R	K	G	F	A	G	Y	D	H	P	N	Q	Y	L	V	K	P	A	T	T	I	A	D	N	M	M	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	M	Q	H	P	A	Q	D	K	E	T	Q	Q	K	L	A	E	L	E	K	K	T	G	K	K	P	N	V	V	V	F	L	L	D	D	V	G	W	M	D	V	G	F	N	G	G	G	V	A	V	G	N	P	T	P	D	I	D	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	S	Q	G	L	I	L	T	S	A	Y	S	Q	P	S	S	S	P	T	R	A	T	I	L	T	G	Q	Y	S	I	H	H	G	I	L	M	P	P	M	Y	G	Q	P	G	G	L	Q	G	L	T	T	L	P	Q	L	L	H	D	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	V	T	Q	A	I	G	K	W	H	M	G	E	N	K	E	S	Q	P	Q	N	V	G	F	D	D	F	R	G	F	N	S	V	S	D	M	Y	T	E	W	R	D	V	H	V	N	P	E	V	A	L	S	P	D	R	S	E	Y	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																													?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	L	P	F	S	K	D	D	V	H	A	V	R	G	G	E	Q	Q	A	I	A	D	I	T	P	K	Y	M	E	D	L	D	Q	R	W	M	D	Y	G	V	K	F	L	D	K	M	A	K	S	D	K	P	F	F	L	Y	Y	G	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	C	H	F	D	N	Y	P	N	A	K	Y	A	G	S	S	P	A	R	T	S	Y	G	D	C	M	V	E	M	N	D	V	F	A	N	L	Y	K	T	L	E	K	N	G	Q	L	D	N	T	L	I	V	F	T	S	D	N	G	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	E	V	P	P	H	G	R	T	P	F	R	G	A	K	G	S	T	W	E	G	G	V	R	V	P	T	F	V	Y	W	K	G	M	I	Q	P	R	K	S	D	G	I	V	D	L	A	D	L	F	P	T	A	L	D	L	A	G	H	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	A	K	V	A	N	L	V	P	K	T	T	F	I	D	G	V	D	Q	T	S	F	F	L	G	T	N	G	Q	S	N	R	K	A	E	H	Y	F	L	N	G	K	L	A	A	V	R	M	D	E	F	K	Y	H	V	L	I	Q	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?																														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Y	A	Y	T	Q	S	G	Y	Q	G	G	F	T	G	T	V	M	Q	T	A	G	S	S	V	F	N	L	Y	T	D	P	Q	E	S	D	S	I	G	V	R	H	I	P	M	G	V	P	L	Q	T	E	M	H	A	Y	M	E	I	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Sequence		K	Y	P	P	R	A	Q	I	K	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand