Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31060 Date Thu Jan 5 11:46:56 GMT 2012 Unique Job ID 47157f59a703f3a3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	L	Q	I	L	Q	G	T	F	R	L	S	D	T	K	T	L	Q	L	P	Q	L	T	L	N	A	G	D	S	W	A	F	V	G	S	N	G	S	G	K	S	A	L	A	R	A	L	A	G	E	L	P	L	L	K	G	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	S	Q	F	S	H	I	T	R	L	S	F	E	Q	L	Q	K	L	V	S	D	E	W	Q	R	N	N	T	D	M	L	G	P	G	E	D	D	T	G	R	T	T	A	E	I	I	Q	D	E	V	K	D	A	P	R	C	M	Q	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?										?										?	?	?	?			?							?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	Q	F	G	I	T	A	L	L	D	R	R	F	K	Y	L	S	T	G	E	T	R	K	T	L	L	C	Q	A	L	M	S	E	P	D	L	L	I	L	D	E	P	F	D	G	L	D	V	A	S	R	Q	Q	L	A	E	R	L	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?			?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	H	Q	S	G	I	T	L	V	L	V	L	N	R	F	D	E	I	P	E	F	V	Q	F	A	G	V	L	A	D	C	T	L	A	E	T	G	A	K	E	E	L	L	Q	Q	A	L	V	A	Q	L	A	H	S	E	Q	L	E	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	L	P	E	P	D	E	P	S	A	R	H	A	L	P	A	N	E	P	R	I	V	L	N	N	G	V	V	S	Y	N	D	R	P	I	L	N	N	L	S	W	Q	V	N	P	G	E	H	W	Q	I	V	G	P	N	G	A	G	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	L	L	S	L	V	T	G	D	H	P	Q	G	Y	S	N	D	L	T	L	F	G	R	R	R	G	S	G	E	T	I	W	D	I	K	K	H	I	G	Y	V	S	S	S	L	H	L	D	Y	R	V	S	T	T	V	R	N	V	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?						?										?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	G	Y	F	D	S	I	G	I	Y	Q	A	V	S	D	R	Q	Q	K	L	V	Q	Q	W	L	D	I	L	G	I	D	K	R	T	A	D	A	P	F	H	S	L	S	W	G	Q	Q	R	L	A	L	I	V	R	A	L	V	K	H	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	L	L	I	L	D	E	P	L	Q	G	L	D	P	L	N	R	Q	L	I	R	R	F	V	D	V	L	I	S	E	G	E	T	Q	L	L	F	V	S	H	H	A	E	D	A	P	A	C	I	T	H	R	L	E	F	V	P	D	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Sequence		L	Y	R	Y	V	L	T	K	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand