Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32701 Date Thu Jan 5 11:50:21 GMT 2012 Unique Job ID 45dcf1aa1162ee56

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	H	R	A	R	H	Q	L	L	A	L	P	G	I	I	F	L	V	L	F	P	I	I	L	S	L	W	I	A	F	L	W	A	K	S	E	V	N	N	Q	L	R	T	F	A	Q	L	A	L	D	K	S	E	L	V	I	R	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	L	V	S	D	A	A	E	R	Y	Q	G	Q	V	C	T	P	A	H	Q	K	R	M	L	N	I	I	R	G	Y	L	Y	I	N	E	L	I	Y	A	R	D	N	H	F	L	C	S	S	L	I	A	P	V	N	G	Y	T	I	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?														?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	D	Y	K	R	E	P	N	V	S	I	Y	Y	Y	R	D	T	P	F	F	S	G	Y	K	M	T	Y	M	Q	R	G	N	Y	V	A	V	I	N	P	L	F	W	S	E	V	M	S	D	D	P	T	L	Q	W	G	V	Y	D	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	K	T	F	F	S	L	S	K	E	A	S	A	A	T	F	S	P	L	I	H	L	K	D	L	T	V	Q	R	N	G	Y	L	Y	A	T	V	Y	S	T	K	R	P	I	A	A	I	V	A	T	S	Y	Q	R	L	I	T	H	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	H	L	I	F	A	L	P	A	G	I	L	G	S	L	V	L	L	L	L	W	L	R	I	R	Q	N	Y	L	S	P	K	R	K	L	Q	R	A	L	E	K	H	Q	L	C	L	Y	Y	Q	P	I	I	D	I	K	T	E	K	C	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	E	A	L	L	R	W	P	G	E	Q	G	Q	I	M	N	P	A	E	F	I	P	L	A	E	K	E	G	M	I	E	Q	I	T	D	Y	V	I	D	N	V	F	R	D	L	G	D	Y	L	A	T	H	A	D	R	Y	V	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	L	S	A	S	D	F	H	T	S	R	L	I	A	R	I	N	Q	K	T	E	Q	Y	A	V	R	P	Q	Q	I	K	F	E	V	T	E	H	A	F	L	D	V	D	K	M	T	P	I	I	L	A	F	R	Q	A	G	Y	E	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	D	D	F	G	I	G	Y	S	N	L	H	N	L	K	S	L	N	V	D	I	L	K	I	D	K	S	F	V	E	T	L	T	T	H	K	T	S	H	L	I	A	E	H	I	I	E	L	A	H	S	L	G	L	K	T	I	A	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	E	T	E	E	Q	V	N	W	L	R	K	R	G	V	R	Y	C	Q	G	W	F	F	A	K	A	M	P	P	Q	V	F	M	Q	W	M	E	Q	L	P	A	R	E	L	T	R	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand