Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75958 Date Thu Jan 5 12:16:27 GMT 2012 Unique Job ID 45746946a7ff18a9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	M	P	L	S	L	L	I	G	L	R	F	S	R	G	R	R	R	G	G	M	V	S	L	I	S	V	I	S	T	I	G	I	A	L	G	V	A	V	L	I	V	G	L	S	A	M	N	G	F	E	R	E	L	N	N	R	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?														?	?	?	?	?																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	V	V	P	H	G	E	I	E	A	V	D	Q	P	W	T	N	W	Q	E	A	L	D	H	V	Q	K	V	P	G	I	A	A	A	A	P	Y	I	N	F	T	G	L	V	E	S	G	A	N	L	R	A	I	Q	V	K	G	V	N	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?																													?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	Q	E	Q	R	L	S	A	L	P	S	F	V	Q	G	D	A	W	R	N	F	K	A	G	E	Q	Q	I	I	I	G	K	G	V	A	D	A	L	K	V	K	Q	G	D	W	V	S	I	M	I	P	N	S	N	P	E	H	K	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?				?	?		?		?	?		?	?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	P	K	R	V	R	L	H	V	A	G	I	L	Q	L	S	G	Q	L	D	H	S	F	A	M	I	P	L	A	D	A	Q	Q	Y	L	D	M	G	S	S	V	S	G	I	A	L	K	M	T	D	V	F	N	A	N	K	L	V	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?										?	?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	G	E	V	T	N	S	Y	V	Y	I	K	S	W	I	G	T	Y	G	Y	M	Y	R	D	I	Q	M	I	R	A	I	M	Y	L	A	M	V	L	V	I	G	V	A	C	F	N	I	V	S	T	L	V	M	A	V	K	D	K	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	I	A	V	L	R	T	L	G	A	K	D	G	L	I	R	A	I	F	V	W	Y	G	L	L	A	G	L	F	G	S	L	C	G	V	I	I	G	V	V	V	S	L	Q	L	T	P	I	I	E	W	I	E	K	L	I	G	H	Q	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?		?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Sequence		L	S	S	D	I	Y	F	I	D	F	L	P	S	E	L	H	W	L	D	V	F	Y	V	L	V	T	A	L	L	L	S	L	L	A	S	W	Y	P	A	R	R	A	S	N	I	D	P	A	R	V	L	S	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																											?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand