Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ADG7 Date Thu Jan 5 11:20:59 GMT 2012 Unique Job ID 457124733e888748

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	R	I	A	K	E	A	L	T	F	D	D	V	L	L	V	P	A	H	S	T	V	L	P	N	T	A	D	L	S	T	Q	L	T	K	T	I	R	L	N	I	P	M	L	S	A	A	M	D	T	V	T	E	A	R	L	A	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?														?		?											?	?	?	?												?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	A	Q	E	G	G	I	G	F	I	H	K	N	M	S	I	E	R	Q	A	E	E	V	R	R	V	K	K	H	E	S	G	V	V	T	D	P	Q	T	V	L	P	T	T	T	L	R	E	V	K	E	L	T	E	R	N	G	F	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?									?		?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	P	V	V	T	E	E	N	E	L	V	G	I	I	T	G	R	D	V	R	F	V	T	D	L	N	Q	P	V	S	V	Y	M	T	P	K	E	R	L	V	T	V	R	E	G	E	A	R	E	V	V	L	A	K	M	H	E	K	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	K	A	L	V	V	D	D	E	F	H	L	I	G	M	I	T	V	K	D	F	Q	K	A	E	R	K	P	N	A	C	K	D	E	Q	G	R	L	R	V	G	A	A	V	G	A	G	A	G	N	E	E	R	V	D	A	L	V	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	V	D	V	L	L	I	D	S	S	H	G	H	S	E	G	V	L	Q	R	I	R	E	T	R	A	K	Y	P	D	L	Q	I	I	G	G	N	V	A	T	A	A	G	A	R	A	L	A	E	A	G	C	S	A	V	K	V	G	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	G	S	I	C	T	T	R	I	V	T	G	V	G	V	P	Q	I	T	A	V	A	D	A	V	E	A	L	E	G	T	G	I	P	V	I	A	D	G	G	I	R	F	S	G	D	I	A	K	A	I	A	A	G	A	S	A	V	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	S	M	L	A	G	T	E	E	S	P	G	E	I	E	L	Y	Q	G	R	S	Y	K	S	Y	R	G	M	G	S	L	G	A	M	S	K	G	S	S	D	R	Y	F	Q	S	D	N	A	A	D	K	L	V	P	E	G	I	E	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	A	Y	K	G	R	L	K	E	I	I	H	Q	Q	M	G	G	L	R	S	C	M	G	L	T	G	C	G	T	I	D	E	L	R	T	K	A	E	F	V	R	I	S	G	A	G	I	Q	E	S	H	V	H	D	V	T	I	T	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	P	N	Y	R	L	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand