Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24181 Date Thu Jan 5 11:40:58 GMT 2012 Unique Job ID 44c9a2357485fc67

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	N	F	F	I	R	R	P	I	F	A	W	V	L	A	I	I	L	M	M	A	G	A	L	A	I	L	Q	L	P	V	A	Q	Y	P	T	I	A	P	P	A	V	S	V	S	A	N	Y	P	G	A	D	A	Q	T	V	Q	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	T	Q	V	I	E	Q	N	M	N	G	I	D	N	L	M	Y	M	S	S	T	S	D	S	A	G	S	V	T	I	T	L	T	F	Q	S	G	T	D	P	D	I	A	Q	V	Q	V	Q	N	K	L	Q	L	A	T	P	L	L	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?								?	?	?	?																															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	V	Q	Q	Q	G	I	S	V	E	K	S	S	S	S	Y	L	M	V	A	G	F	V	S	D	N	P	G	T	T	Q	D	D	I	S	D	Y	V	A	S	N	V	K	D	T	L	S	R	L	N	G	V	G	D	V	Q	L	F	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?			?					?	?	?	?	?	?										?		?	?		?																		?	?	?		?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	Y	A	M	R	I	W	L	D	A	D	L	L	N	K	Y	K	L	T	P	V	D	V	I	N	Q	L	K	V	Q	N	D	Q	I	A	A	G	Q	L	G	G	T	P	A	L	P	G	Q	Q	L	N	A	S	I	I	A	Q	T	R	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?														?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	N	P	E	E	F	G	K	V	T	L	R	V	N	S	D	G	S	V	V	R	L	K	D	V	A	R	V	E	L	G	G	E	N	Y	N	V	I	A	R	I	N	G	K	P	A	A	G	L	G	I	K	L	A	T	G	A	N	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																						?	?	?																		?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	T	A	K	A	I	K	A	K	L	A	E	L	Q	P	F	F	P	Q	G	M	K	V	L	Y	P	Y	D	T	T	P	F	V	Q	L	S	I	H	E	V	V	K	T	L	F	E	A	I	M	L	V	F	L	V	M	Y	L	F	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	M	R	A	T	L	I	P	T	I	A	V	P	V	V	L	L	G	T	F	A	I	L	A	A	F	G	Y	S	I	N	T	L	T	M	F	G	M	V	L	A	I	G	L	L	V	D	D	A	I	V	V	V	E	N	V	E	R	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	E	D	K	L	P	P	K	E	A	T	E	K	S	M	S	Q	I	Q	G	A	L	V	G	I	A	M	V	L	S	A	V	F	I	P	M	A	F	F	G	G	S	T	G	A	I	Y	R	Q	F	S	I	T	I	V	S	A	M	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	V	L	V	A	L	I	L	T	P	A	L	C	A	T	L	L	K	P	V	S	A	E	H	H	E	N	K	G	G	F	F	G	W	F	N	T	T	F	D	H	S	V	N	H	Y	T	N	S	V	G	K	I	L	G	S	T	G	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	L	I	Y	A	L	I	V	A	G	M	V	V	L	F	L	R	L	P	S	S	F	L	P	E	E	D	Q	G	V	F	L	T	M	I	Q	L	P	A	G	A	T	Q	E	R	T	Q	K	V	L	D	Q	V	T	D	Y	Y	L	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?																		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	K	A	N	V	E	S	V	F	T	V	N	G	F	S	F	S	G	Q	A	Q	N	A	G	M	A	F	V	S	L	K	P	W	E	E	R	N	G	D	E	N	S	A	E	A	V	I	H	R	A	K	M	E	L	G	K	I	R	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		F	V	I	P	F	N	M	P	A	I	V	E	L	G	T	A	T	G	F	D	F	E	L	I	D	Q	A	G	L	G	H	D	A	L	T	Q	A	R	N	Q	L	L	G	M	A	A	Q	H	P	A	S	L	V	S	V	R	P	N	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?																					?	?	?			?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		E	D	T	A	Q	F	K	L	E	V	D	Q	E	K	A	Q	A	L	G	V	S	L	S	D	I	N	Q	T	I	S	T	A	L	G	G	T	Y	V	N	D	F	I	D	R	G	R	V	K	K	L	Y	V	Q	A	D	A	K	F	R	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?																														?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		L	P	E	D	V	D	K	L	Y	V	R	S	A	N	G	E	M	V	P	F	S	A	F	T	T	S	H	W	V	Y	G	S	P	R	L	E	R	Y	N	G	L	P	S	M	E	I	Q	G	E	A	A	P	G	T	S	S	G	D	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?				?					?		?		?	?				?									?	?	?	?	?	?					?	?	?									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		A	L	M	E	N	L	A	S	K	L	P	A	G	I	G	Y	D	W	T	G	M	S	Y	Q	E	R	L	S	G	N	Q	A	P	A	L	V	A	I	S	F	V	V	V	F	L	C	L	A	A	L	Y	E	S	W	S	I	P	V	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		M	L	V	V	P	L	G	I	V	G	V	L	L	A	A	T	L	F	N	Q	K	N	D	V	Y	F	M	V	G	L	L	T	T	I	G	L	S	A	K	N	A	I	L	I	V	E	F	A	K	D	L	M	E	K	E	G	K	G	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		E	A	T	L	M	A	V	R	M	R	L	R	P	I	L	M	T	S	L	A	F	I	L	G	V	L	P	L	A	I	S	N	G	A	G	S	G	A	Q	N	A	V	G	I	G	V	M	G	G	M	V	S	A	T	L	L	A	I	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.
Sequence		V	P	V	F	F	V	V	I	R	R	C	F	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?
Disorder confidence