Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37349 Date Thu Jan 5 11:55:28 GMT 2012 Unique Job ID 4489bf3722a48842

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	V	N	L	V	I	V	S	H	S	S	R	L	G	E	G	V	G	E	L	A	R	Q	M	L	M	S	D	S	C	K	I	A	I	A	A	G	I	D	D	P	Q	N	P	I	G	T	D	A	V	K	V	M	E	A	I	E	S	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	A	D	H	V	L	V	M	M	D	M	G	S	A	L	L	S	A	E	T	A	L	E	L	L	A	P	E	I	A	A	K	V	R	L	C	A	A	P	L	V	E	G	T	L	A	A	T	V	S	A	A	S	G	A	D	I	D	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?																												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	F	D	A	M	H	A	L	E	A	K	R	E	Q	L	G	L	P	S	S	D	T	E	I	S	D	T	C	P	A	Y	D	E	E	A	R	S	L	A	V	V	I	K	N	R	N	G	L	H	V	R	P	A	S	R	L	V	Y	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	T	F	N	A	D	M	L	L	E	K	N	G	K	C	V	T	P	E	S	I	N	Q	I	A	L	L	Q	V	R	Y	N	D	T	L	R	L	I	A	K	G	P	E	A	E	E	A	L	I	A	F	R	Q	L	A	E	D	N	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?									?																														?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	T	E	E	V	A	P	P	T	L	R	P	V	P	P	V	S	G	K	A	F	Y	Y	Q	P	V	L	C	T	V	Q	A	K	S	T	L	T	V	E	E	E	Q	D	R	L	R	Q	A	I	D	F	T	L	L	D	L	M	T	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	K	A	E	A	S	G	L	D	D	I	A	A	I	F	S	G	H	H	T	L	L	D	D	P	E	L	L	A	A	A	S	E	L	L	Q	H	E	H	C	T	A	E	Y	A	W	Q	Q	V	L	K	E	L	S	Q	Q	Y	Q	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?																																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	D	E	Y	L	Q	A	R	Y	I	D	V	D	D	L	L	H	R	T	L	V	H	L	T	Q	T	K	E	E	L	P	Q	F	N	S	P	T	I	L	L	A	E	N	I	Y	P	S	T	V	L	Q	L	D	P	A	V	V	K	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																									?	?	?	?	?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Sequence		C	L	S	A	G	S	P	V	S	H	S	A	L	I	A	R	E	L	G	I	G	W	I	C	Q	Q	G	E	K	L	Y	A	I	Q	P	E	E	T	L	T	L	D	V	K	T	Q	R	F	N	R	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?			?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand