Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75870 Date Thu Jan 5 12:15:19 GMT 2012 Unique Job ID 438f060a092c7341

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	S	P	L	L	K	R	Y	T	W	N	S	A	W	L	Y	Y	A	R	I	F	I	A	L	C	G	T	T	A	F	P	W	W	L	G	D	V	K	L	T	I	P	L	T	L	G	M	V	A	A	A	L	T	D	L	D	D	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	G	R	L	R	N	L	I	I	T	L	F	C	F	F	I	A	S	A	S	V	E	L	L	F	P	W	P	W	L	F	A	I	G	L	T	L	S	T	S	G	F	I	L	L	G	G	L	G	Q	R	Y	A	T	I	A	F	G	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	I	A	I	Y	T	M	L	G	T	S	L	Y	E	H	W	Y	Q	Q	P	M	Y	L	L	A	G	A	V	W	Y	N	V	L	T	L	I	G	H	L	L	F	P	V	R	P	L	Q	D	N	L	A	R	C	Y	E	Q	L	A	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?					?																											?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	E	L	K	S	R	M	F	D	P	D	I	E	D	Q	S	Q	A	P	L	Y	D	L	A	L	A	N	G	L	L	M	A	T	L	N	Q	T	K	L	S	L	L	T	R	L	R	G	D	R	G	Q	R	G	T	R	R	T	L	H	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	F	V	A	Q	D	I	H	E	R	A	S	S	S	H	I	Q	Y	Q	T	L	R	E	H	F	R	H	S	D	V	L	F	R	F	Q	R	L	M	S	M	Q	G	Q	A	C	Q	Q	L	S	R	C	I	L	L	R	Q	P	Y	Q	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	P	H	F	E	R	A	F	T	H	I	D	A	A	L	E	R	M	R	D	N	G	A	P	A	D	L	L	K	T	L	G	F	L	L	N	N	L	R	A	I	D	A	Q	L	A	T	I	E	S	E	Q	A	Q	A	L	P	H	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?		?																															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	E	N	E	L	A	D	D	S	P	H	G	L	S	D	I	W	L	R	L	S	R	H	F	T	P	E	S	A	L	F	R	H	A	V	R	M	S	L	V	L	C	F	G	Y	A	I	I	Q	I	T	G	M	H	H	G	Y	W	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	T	S	L	F	V	C	Q	P	N	Y	N	A	T	R	H	R	L	K	L	R	I	I	G	T	L	V	G	I	A	I	G	I	P	V	L	W	F	V	P	S	L	E	G	Q	L	V	L	L	V	I	T	G	V	L	F	F	A	F	R
Secondary structure
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Disorder										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	V	Q	Y	A	H	A	T	M	F	I	T	L	L	V	L	L	C	F	N	L	L	G	E	G	F	E	V	A	L	P	R	V	I	D	T	L	I	G	C	A	I	A	W	A	A	V	S	Y	I	W	P	D	W	Q	F	R	N	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		R	M	L	E	R	A	T	E	A	N	C	R	Y	L	D	A	I	L	E	Q	Y	H	Q	G	R	D	N	R	L	A	Y	R	I	A	R	R	D	A	H	N	R	D	A	E	L	A	S	V	V	S	N	M	S	S	E	P	N	V	T	P
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	I	R	E	A	A	F	R	L	L	C	L	N	H	T	F	T	S	Y	I	S	A	L	G	A	H	R	E	Q	L	T	N	P	E	I	L	A	F	L	D	D	A	V	C	Y	V	D	D	A	L	H	H	Q	P	A	D	E	E	R	V
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	E	A	L	A	S	L	K	Q	R	M	Q	Q	L	E	P	R	A	D	S	K	E	P	L	V	V	Q	Q	V	G	L	L	I	A	L	L	P	E	I	G	R	L	Q	R	Q	I	T	Q	V	P	Q	E	T	P	V	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																										?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand