Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45423 Date Thu Jan 5 12:02:36 GMT 2012 Unique Job ID 42fa58ed444ff121

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	S	L	S	E	G	T	T	A	G	Y	Q	Q	I	H	D	G	I	I	H	L	V	D	S	A	R	T	E	T	V	R	S	V	N	A	L	M	T	A	T	Y	Q	E	I	G	R	R	I	V	E	F	E	Q	G	G	E	A	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	Y	G	A	Q	L	I	K	R	L	S	K	D	L	C	L	R	Y	K	R	G	F	S	A	K	N	L	R	Q	M	R	L	F	Y	L	F	F	Q	H	V	E	I	H	Q	T	M	S	G	E	L	T	P	L	G	I	P	Q	T	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	E	F	P	S	A	K	I	W	Q	T	L	S	A	K	S	F	P	L	P	R	S	T	Y	V	R	L	L	S	V	K	N	A	D	A	R	S	F	Y	E	K	E	T	L	R	C	G	W	S	V	R	Q	L	E	R	Q	I	A	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?									?	?	?	?		?																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	Y	E	R	T	L	L	S	H	D	K	S	A	M	L	Q	Q	H	A	P	A	E	T	H	I	L	P	Q	Q	A	I	R	D	P	F	V	L	E	F	L	E	L	K	D	E	Y	S	E	S	D	F	E	E	A	L	I	N	H	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?			?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	F	M	L	E	L	G	D	D	F	A	F	V	G	R	Q	R	R	L	R	I	D	D	N	W	F	R	V	D	L	L	F	F	H	R	R	L	R	C	L	L	I	V	D	L	K	V	G	K	F	S	Y	S	D	A	G	Q	M	N	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	L	N	Y	A	K	E	H	W	T	L	P	D	E	N	P	P	I	G	L	V	L	C	A	E	K	G	A	G	E	A	H	Y	A	L	A	G	L	P	N	T	V	L	A	S	E	Y	K	M	Q	L	P	D	E	K	R	L	A	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?																								?	?	?	?	?		?			?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Sequence		L	V	R	T	Q	A	V	L	E	E	G	Y	R	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand