Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A9P6 Date Thu Jan 5 11:10:55 GMT 2012 Unique Job ID 429f203ce44b3973

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	E	F	E	T	T	F	A	D	L	G	L	K	A	P	I	L	E	A	L	N	D	L	G	Y	E	K	P	S	P	I	Q	A	E	C	I	P	H	L	L	N	G	R	D	V	L	G	M	A	Q	T	G	S	G	K	T	A	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	L	P	L	L	Q	N	L	D	P	E	L	K	A	P	Q	I	L	V	L	A	P	T	R	E	L	A	V	Q	V	A	E	A	M	T	D	F	S	K	H	M	R	G	V	N	V	V	A	L	Y	G	G	Q	R	Y	D	V	Q	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	L	R	Q	G	P	Q	I	V	V	G	T	P	G	R	L	L	D	H	L	K	R	G	T	L	D	L	S	K	L	S	G	L	V	L	D	E	A	D	E	M	L	R	M	G	F	I	E	D	V	E	T	I	M	A	Q	I	P	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		H	Q	T	A	L	F	S	A	T	M	P	E	A	I	R	R	I	T	R	R	F	M	K	E	P	Q	E	V	R	I	Q	S	S	V	T	T	R	P	D	I	S	Q	S	Y	W	T	V	W	G	M	R	K	N	E	A	L	V	R	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	A	E	D	F	D	A	A	I	I	F	V	R	T	K	N	A	T	L	E	V	A	E	A	L	E	R	N	G	Y	N	S	A	A	L	N	G	D	M	N	Q	A	L	R	E	Q	T	L	E	R	L	K	D	G	R	L	D	I	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	T	D	V	A	A	R	G	L	D	V	E	R	I	S	L	V	V	N	Y	D	I	P	M	D	S	E	S	Y	V	H	R	I	G	R	T	G	R	A	G	R	A	G	R	A	L	L	F	V	E	N	R	E	R	R	L	L	R	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	R	T	M	K	L	T	I	P	E	V	E	L	P	N	A	E	L	L	G	K	R	R	L	E	K	F	A	A	K	V	Q	Q	Q	L	E	S	S	D	L	D	Q	Y	R	A	L	L	S	K	I	Q	P	T	A	E	G	E	E	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?				?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	E	T	L	A	A	A	L	L	K	M	A	Q	G	E	R	T	L	I	V	P	P	D	A	P	M	R	P	K	R	E	F	R	D	R	D	D	R	G	P	R	D	R	N	D	R	G	P	R	G	D	R	E	D	R	P	R	R	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	D	V	G	D	M	Q	L	Y	R	I	E	V	G	R	D	D	G	V	E	V	R	H	I	V	G	A	I	A	N	E	G	D	I	S	S	R	Y	I	G	N	I	K	L	F	A	S	H	S	T	I	E	L	P	K	G	M	P	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?											?	?	?	?	?													?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	L	Q	H	F	T	R	T	R	I	L	N	K	P	M	N	M	Q	L	L	G	D	A	Q	P	H	T	G	G	E	R	R	G	G	G	R	G	F	G	G	E	R	R	E	G	G	R	N	F	S	G	E	R	R	E	G	G	R	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	R	R	F	S	G	E	R	R	E	G	R	A	P	R	R	D	D	S	T	G	R	R	R	F	G	G	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand