Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76186 Date Thu Jan 5 12:20:15 GMT 2012 Unique Job ID 426a5911f7d96b95

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	A	S	S	W	S	L	R	N	L	P	W	F	R	A	T	L	A	Q	W	R	Y	A	L	R	N	T	I	A	M	C	L	A	L	T	V	A	Y	Y	L	N	L	D	E	P	Y	W	A	M	T	S	A	A	V	V	S	F	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?				?			?																																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	G	G	V	I	S	K	S	L	G	R	I	A	G	S	L	L	G	A	I	A	A	L	L	L	A	G	H	T	L	N	E	P	W	F	F	L	L	S	M	S	A	W	L	G	F	C	T	W	A	C	A	H	F	T	N	N	V	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	F	Q	L	A	G	Y	T	A	A	I	I	A	F	P	M	V	N	I	T	E	A	S	Q	L	W	D	I	A	Q	A	R	V	C	E	V	I	V	G	I	L	C	G	G	M	M	M	M	I	L	P	S	S	S	D	A	T	A	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	A	L	K	N	M	H	A	R	L	L	E	H	A	S	L	L	W	Q	P	E	T	T	D	A	I	R	A	A	H	E	G	V	I	G	Q	I	L	T	M	N	L	L	R	I	Q	A	F	W	S	H	Y	R	F	R	Q	Q	N	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	N	A	L	L	H	Q	Q	L	R	M	T	S	V	I	S	S	L	R	R	M	L	L	N	W	P	S	P	P	G	A	T	R	E	I	L	E	Q	L	L	T	A	L	A	S	S	Q	T	D	V	Y	T	V	A	R	I	I	A	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?		?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	P	T	N	V	A	D	Y	R	H	V	A	F	W	Q	R	L	R	Y	F	C	R	L	Y	L	Q	S	S	Q	E	L	H	R	L	Q	S	G	V	D	D	H	T	R	L	P	R	T	S	G	L	A	R	H	T	D	N	A	E	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?			?	?		?																										?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		W	S	G	L	R	T	F	C	T	L	M	M	I	G	A	W	S	I	A	S	Q	W	D	A	G	A	N	A	L	T	L	A	A	I	S	C	V	L	Y	S	A	V	A	A	P	F	K	S	L	S	L	L	M	R	T	L	V	L	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	F	S	F	V	V	K	F	G	L	M	V	Q	I	S	D	L	W	Q	F	L	L	F	L	F	P	L	L	A	T	M	Q	L	L	K	L	Q	M	P	K	F	A	A	L	W	G	Q	L	I	V	F	M	G	S	F	I	A	V	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?																	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		P	P	V	Y	D	F	A	D	F	L	N	D	N	L	A	K	I	V	G	V	A	L	A	W	L	A	F	A	I	L	R	P	G	S	D	A	R	K	S	R	R	H	I	R	A	L	R	R	D	F	V	D	Q	L	S	R	H	P	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	E	S	E	F	E	S	L	T	Y	H	H	V	S	Q	L	S	N	S	Q	D	A	L	A	R	R	W	L	L	R	W	G	V	V	L	L	N	C	S	H	V	V	W	Q	L	R	D	W	E	S	R	S	D	P	L	S	R	V	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	C	I	S	L	L	R	G	V	M	S	E	R	G	V	Q	Q	K	S	L	A	A	T	L	E	E	L	Q	R	I	C	D	S	L	A	R	H	H	Q	P	A	A	R	E	L	A	A	I	V	W	R	L	Y	C	S	L	S	Q	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Sequence		Q	A	P	P	Q	G	T	L	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand