Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77187 Date Thu Jan 5 12:26:10 GMT 2012 Unique Job ID 418f69b07df8d6cb

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	V	K	I	V	I	K	P	N	T	Y	F	D	S	V	S	L	M	S	I	S	T	R	A	N	K	L	D	G	V	E	Q	A	F	V	A	M	A	T	E	M	N	K	G	V	L	K	N	L	G	L	L	T	P	E	L	E	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																							?	?	?	?	?								?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	N	G	D	L	M	I	V	I	N	G	K	S	G	A	D	N	E	Q	L	L	V	E	I	E	E	L	F	N	T	K	A	Q	S	G	S	H	E	A	R	Y	A	T	I	G	S	A	K	K	H	I	P	E	S	N	L	A	V	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	N	G	L	F	A	A	R	E	A	R	Q	A	L	Q	N	D	L	N	V	M	L	F	S	D	N	V	S	V	E	D	E	L	A	L	K	Q	L	A	H	E	K	G	L	L	M	M	G	P	D	C	G	T	A	I	I	N	G	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	C	F	G	N	A	V	R	R	G	N	I	G	I	V	G	A	S	G	T	G	S	Q	E	L	S	V	R	I	H	E	F	G	G	G	V	S	Q	L	I	G	T	G	G	R	D	L	S	E	K	I	G	G	L	M	M	L	D	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	M	L	E	N	D	P	Q	T	E	I	I	A	L	I	S	K	P	P	A	P	A	V	A	R	K	V	L	E	R	A	R	A	C	R	K	P	V	V	V	C	F	L	D	R	G	E	T	P	V	D	E	Q	G	L	Q	F	A	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	K	E	A	A	L	K	A	V	M	L	S	G	V	K	Q	E	N	L	D	L	H	T	L	N	Q	P	L	I	A	D	V	R	A	R	L	Q	P	Q	Q	K	Y	I	R	G	L	F	C	G	G	T	L	C	D	E	T	M	F	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	E	K	H	G	D	V	Y	S	N	I	Q	P	D	P	E	F	R	L	K	D	I	N	R	S	I	K	H	T	F	L	D	F	G	D	D	D	F	T	N	G	K	P	H	P	M	I	D	P	T	N	R	I	S	R	L	I	E	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	D	P	E	V	A	V	I	V	M	D	F	V	L	G	F	G	S	H	E	D	P	V	G	S	T	I	E	T	I	K	E	A	K	A	I	A	A	A	E	G	R	E	L	I	I	L	A	Y	V	L	G	T	D	L	D	T	P	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?																		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Sequence		E	Q	Q	S	Q	M	L	L	D	A	G	V	I	L	A	S	S	S	T	N	T	G	L	L	A	R	E	F	I	C	K	G	E	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand