Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P15078 Date Thu Jan 5 11:34:36 GMT 2012 Unique Job ID 418770152a832dd9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	S	G	K	Y	L	V	W	T	V	L	S	V	M	G	A	F	A	L	G	Y	I	A	L	N	R	G	E	Q	I	N	A	L	W	I	V	V	A	S	V	C	I	Y	L	I	A	Y	R	F	Y	G	L	Y	I	A	K	N	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	A	V	D	P	T	R	M	T	P	A	V	R	H	N	D	G	L	D	Y	V	P	T	D	K	K	V	L	F	G	H	H	F	A	A	I	A	G	A	G	P	L	V	G	P	V	L	A	A	Q	M	G	Y	L	P	G	M	I	W	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	G	V	V	L	A	G	A	V	Q	D	F	M	V	L	F	V	S	T	R	R	D	G	R	S	L	G	E	L	V	K	E	E	M	G	P	T	A	G	V	I	A	L	V	A	C	F	M	I	M	V	I	I	L	A	V	L	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	V	V	K	A	L	T	H	S	P	W	G	T	Y	T	V	A	F	T	I	P	L	A	L	F	M	G	I	Y	L	R	Y	L	R	P	G	R	I	G	E	V	S	V	I	G	L	V	F	L	I	F	A	I	I	S	G	G	W	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																								?		?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	S	P	T	W	A	P	Y	F	D	F	T	G	V	Q	L	T	W	M	L	V	G	Y	G	F	V	A	A	V	L	P	V	W	L	L	L	A	P	R	D	Y	L	S	T	F	L	K	I	G	T	I	V	G	L	A	V	G	I	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	R	P	T	L	T	M	P	A	L	T	K	F	V	D	G	T	G	P	V	W	T	G	N	L	F	P	F	L	F	I	T	I	A	C	G	A	V	S	G	F	H	A	L	I	S	S	G	T	T	P	K	M	L	A	N	E	G	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?			?	?	?	?		?																									?	?				?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		C	F	I	G	Y	G	G	M	L	M	E	S	F	V	A	I	M	A	L	V	S	A	C	I	I	D	P	G	V	Y	F	A	M	N	S	P	M	A	V	L	A	P	A	G	T	A	D	V	V	A	S	A	A	Q	V	V	S	S	W	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?		?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	S	I	T	P	D	T	L	N	Q	I	A	S	E	V	G	E	Q	S	I	I	S	R	A	G	G	A	P	T	L	A	V	G	M	A	Y	I	L	H	G	A	L	G	G	M	M	D	V	A	F	W	Y	H	F	A	I	L	F	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?	?	?	?	?	?		?			?		?	?	?	?	?	?	?	?																		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	F	I	L	T	A	V	D	A	G	T	R	A	A	R	F	M	L	Q	D	L	L	G	V	V	S	P	G	L	K	R	T	D	S	L	P	A	N	L	L	A	T	A	L	C	V	L	A	W	G	Y	F	L	H	Q	G	V	V	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?		?	?	?	?	?	?	?	?		?																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	G	G	I	N	T	L	W	P	L	F	G	I	A	N	Q	M	L	A	G	M	A	L	M	L	C	A	V	V	L	F	K	M	K	R	Q	R	Y	A	W	V	A	L	V	P	T	A	W	L	L	I	C	T	L	T	A	G	W	Q	K
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	F	S	P	D	A	K	V	G	F	L	A	I	A	N	K	F	Q	A	M	I	D	S	G	N	I	P	S	Q	Y	T	E	S	Q	L	A	Q	L	V	F	N	N	R	L	D	A	G	L	T	I	F	F	M	V	V	V	V	V	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.
Sequence		L	F	S	I	K	T	A	L	A	A	L	K	D	P	K	P	T	A	K	E	T	P	Y	E	P	M	P	E	N	V	E	E	I	V	A	Q	A	K	G	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?									?								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand