Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P15639 Date Thu Jan 5 11:34:47 GMT 2012 Unique Job ID 418385fa75a065e3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	Q	R	R	P	V	R	R	A	L	L	S	V	S	D	K	A	G	I	V	E	F	A	Q	A	L	S	A	R	G	V	E	L	L	S	T	G	G	T	A	R	L	L	A	E	K	G	L	P	V	T	E	V	S	D	Y	T	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	E	M	M	D	G	R	V	K	T	L	H	P	K	V	H	G	G	I	L	G	R	R	G	Q	D	D	A	I	M	E	E	H	Q	I	Q	P	I	D	M	V	V	V	N	L	Y	P	F	A	Q	T	V	A	R	E	G	C	S	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?		?	?	?							?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	A	V	E	N	I	D	I	G	G	P	T	M	V	R	S	A	A	K	N	H	K	D	V	A	I	V	V	K	S	S	D	Y	D	A	I	I	K	E	M	D	D	N	E	G	S	L	T	L	A	T	R	F	D	L	A	I	K	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	H	T	A	A	Y	D	S	M	I	A	N	Y	F	G	S	M	V	P	A	Y	H	G	E	S	K	E	A	A	G	R	F	P	R	T	L	N	L	N	F	I	K	K	L	D	M	R	Y	G	E	N	S	H	Q	Q	A	A	F	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?			?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	E	N	V	K	E	A	S	V	A	T	A	T	Q	V	Q	G	K	A	L	S	Y	N	N	I	A	D	T	D	A	A	L	E	C	V	K	E	F	A	E	P	A	C	V	I	V	K	H	A	N	P	C	G	V	A	I	G	N	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	D	A	Y	D	R	A	Y	K	T	D	P	T	S	A	F	G	G	I	I	A	F	N	R	E	L	D	A	E	T	A	Q	A	I	I	S	R	Q	F	V	E	V	I	I	A	P	S	A	S	E	E	A	L	K	I	T	A	A	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	V	R	V	L	T	C	G	Q	W	G	E	R	V	P	G	L	D	F	K	R	V	N	G	G	L	L	V	Q	D	R	D	L	G	M	V	G	A	E	E	L	R	V	V	T	K	R	Q	P	S	E	Q	E	L	R	D	A	L	F	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		W	K	V	A	K	F	V	K	S	N	A	I	V	Y	A	K	N	N	M	T	I	G	I	G	A	G	Q	M	S	R	V	Y	S	A	K	I	A	G	I	K	A	A	D	E	G	L	E	V	K	G	S	S	M	A	S	D	A	F	F	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	R	D	G	I	D	A	A	A	A	A	G	V	T	C	V	I	Q	P	G	G	S	I	R	D	D	E	V	I	A	A	A	D	E	H	G	I	A	M	L	F	T	D	M	R	H	F	R	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand