Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P40719 Date Wed Jan 25 15:20:54 GMT 2012 Unique Job ID 41541c184cc8064b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	F	T	Q	R	L	S	L	R	V	R	L	T	L	I	F	L	I	L	A	S	V	T	W	L	L	S	S	F	V	A	W	K	Q	T	T	D	N	V	D	E	L	F	D	T	Q	L	M	L	F	A	K	R	L	S	T	L	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	E	I	N	A	A	D	R	M	A	Q	T	P	N	R	L	K	H	G	H	V	D	D	D	A	L	T	F	A	I	F	T	H	D	G	R	M	V	L	N	D	G	D	N	G	E	D	I	P	Y	S	Y	Q	R	E	G	F	A	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	L	V	G	E	D	D	P	W	R	F	V	W	M	T	S	P	D	G	K	Y	R	I	V	V	G	Q	E	W	E	Y	R	E	D	M	A	L	A	I	V	A	G	Q	L	I	P	W	L	V	A	L	P	I	M	L	I	I	M	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	L	G	R	E	L	A	P	L	N	K	L	A	L	A	L	R	M	R	D	P	D	S	E	K	P	L	N	A	T	G	V	P	S	E	V	R	P	L	V	E	S	L	N	Q	L	F	A	R	T	H	A	M	M	V	R	E	R	R	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	S	D	A	A	H	E	L	R	S	P	L	T	A	L	K	V	Q	T	E	V	A	Q	L	S	D	D	D	P	Q	A	R	K	K	A	L	L	Q	L	H	S	G	I	D	R	A	T	R	L	V	D	Q	L	L	T	L	S	R	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?			?	?																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	L	D	N	L	Q	D	V	A	E	I	P	L	E	D	L	L	Q	S	S	V	M	D	I	Y	H	T	A	Q	Q	A	K	I	D	V	R	L	T	L	N	A	H	S	I	K	R	T	G	Q	P	L	L	L	S	L	L	V	R	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	D	N	A	V	R	Y	S	P	Q	G	S	V	V	D	V	T	L	N	A	D	N	F	I	V	R	D	N	G	P	G	V	T	P	E	A	L	A	R	I	G	E	R	F	Y	R	P	P	G	Q	T	A	T	G	S	G	L	G	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	V	Q	R	I	A	K	L	H	G	M	N	V	E	F	G	N	A	E	Q	G	G	F	E	A	K	V	S	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand