Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P27896 Date Wed Jan 25 15:20:46 GMT 2012 Unique Job ID 414ef1f881fad2a2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	V	K	R	P	V	S	A	S	L	A	R	A	F	F	Y	I	V	L	L	S	I	L	S	T	G	I	A	L	L	T	L	A	S	S	L	R	D	A	E	A	I	N	I	A	G	S	L	R	M	Q	S	Y	R	L	G	Y	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	S	G	S	P	Q	L	N	A	H	R	Q	L	F	Q	Q	A	L	H	S	P	V	L	T	N	L	N	V	W	Y	V	P	E	A	V	K	T	R	Y	A	H	L	N	A	N	W	L	E	M	N	N	R	L	S	K	G	D	L	P	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?												?			?	?	?				?																									?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	Q	A	N	I	N	N	Y	V	N	Q	I	D	L	F	V	L	A	L	Q	H	Y	A	E	R	K	M	L	L	V	V	A	I	S	L	A	G	G	I	G	I	F	T	L	V	F	F	T	L	R	R	I	R	H	Q	V	V	A	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	Q	L	V	T	A	S	Q	R	I	E	H	G	Q	F	D	S	P	P	L	D	T	N	L	P	N	E	L	G	L	L	A	K	T	F	N	Q	M	S	S	E	L	H	K	L	Y	R	S	L	E	A	S	V	E	E	K	T	R	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	E	A	K	R	R	L	E	V	L	Y	Q	C	S	Q	A	L	N	T	S	Q	I	D	V	H	C	F	R	H	I	L	Q	I	V	R	D	N	E	A	A	E	Y	L	E	L	N	V	G	E	N	W	R	I	S	E	G	Q	P	N	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?		?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	L	P	M	Q	I	L	P	V	T	M	Q	E	T	V	Y	G	E	L	H	W	Q	N	S	H	V	S	S	S	E	P	L	L	N	S	V	S	S	M	L	G	R	G	L	Y	F	N	Q	A	Q	K	H	F	Q	Q	L	L	L	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	R	A	T	I	A	R	E	L	H	D	S	L	A	Q	V	L	S	Y	L	R	I	Q	L	T	L	L	K	R	S	I	P	E	D	N	A	T	A	Q	S	I	M	A	D	F	S	Q	A	L	N	D	A	Y	R	Q	L	R	E	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	T	F	R	L	T	L	Q	Q	A	D	L	P	S	A	L	R	E	M	L	D	T	L	Q	N	Q	T	S	A	K	L	T	L	D	C	R	L	P	T	L	A	L	D	A	Q	M	Q	V	H	L	L	Q	I	I	R	E	A	V	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	M	K	H	A	N	A	S	E	I	A	V	S	C	V	T	A	P	D	G	N	H	T	V	Y	I	R	D	N	G	I	G	I	G	E	P	K	E	P	E	G	H	Y	G	L	N	I	M	R	E	R	A	E	R	L	G	G	T	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	S	Q	P	S	G	G	G	T	L	V	S	I	S	F	R	S	A	E	G	E	E	S	Q	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand