Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16694 Date Thu Jan 5 11:35:44 GMT 2012 Unique Job ID 4076c53e4a1db51f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Y	T	Q	T	L	Y	E	L	S	Q	E	A	E	R	L	L	Q	L	S	R	Q	Q	L	Q	L	L	E	K	M	P	L	S	V	P	G	D	D	A	P	Q	L	A	L	P	W	S	Q	P	N	I	A	E	R	H	A	M	L	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	L	R	K	I	S	R	L	E	M	V	L	A	I	V	G	T	M	K	A	G	K	S	T	T	I	N	A	I	V	G	T	E	V	L	P	N	R	N	R	P	M	T	A	L	P	T	L	I	R	H	T	P	G	Q	K	E	P	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?												?																			?	?					?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		H	F	S	H	V	A	P	I	D	C	L	I	Q	Q	L	Q	Q	R	L	R	D	C	D	I	K	H	L	T	D	V	L	E	I	D	K	D	M	R	A	L	M	Q	R	I	E	N	G	V	A	F	E	K	Y	Y	L	G	A	Q	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	H	C	L	K	S	L	N	D	L	V	R	L	A	K	A	L	D	V	D	F	P	F	S	A	Y	A	A	I	E	H	I	P	V	I	E	V	E	F	V	H	L	A	G	L	E	S	Y	P	G	Q	L	T	L	L	D	T	P	G	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?																							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	E	A	G	Q	P	H	L	Q	K	M	L	N	Q	Q	L	A	R	A	S	A	V	L	A	V	L	D	Y	T	Q	L	K	S	I	S	D	E	E	V	R	E	A	I	L	A	V	G	Q	S	V	P	L	Y	V	L	V	N	K	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	Q	D	R	N	S	D	D	A	D	Q	V	R	A	L	I	S	G	T	L	M	K	G	C	I	T	P	Q	Q	I	F	P	V	S	S	M	W	G	Y	L	A	N	R	A	R	Y	E	L	A	N	N	G	K	L	P	P	P	E	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?		?	?																?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	W	V	E	D	F	A	H	A	A	L	G	R	R	W	R	H	A	D	L	A	D	L	E	H	I	R	H	A	A	D	Q	L	W	E	D	S	L	F	A	Q	P	I	Q	A	L	L	H	A	A	Y	A	N	A	S	L	Y	A	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?		?																		?																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	A	A	H	K	L	L	N	Y	A	Q	Q	A	R	E	Y	L	D	F	R	A	H	G	L	N	V	A	C	E	Q	L	R	Q	N	I	H	Q	I	E	E	S	L	Q	L	L	Q	L	N	Q	A	Q	V	S	G	E	I	K	H	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	L	A	L	T	S	A	N	H	F	L	R	Q	Q	Q	D	A	L	K	V	Q	L	A	A	L	F	Q	D	D	S	E	P	L	S	E	I	R	T	R	C	E	T	L	L	Q	T	A	Q	N	T	I	S	R	D	F	T	L	R	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	L	E	S	T	L	C	R	V	L	T	D	V	I	R	P	I	E	Q	Q	V	K	M	E	L	S	E	S	G	F	R	P	G	F	H	F	P	V	F	H	G	V	V	P	H	F	N	T	R	Q	L	F	S	E	V	I	S	R	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?		?												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	T	D	E	Q	S	T	R	L	G	V	V	R	E	T	F	S	R	W	L	N	Q	P	D	W	G	R	G	N	E	K	S	P	T	E	T	V	D	Y	S	V	L	Q	R	A	L	S	A	E	V	D	L	Y	C	Q	Q	M	A	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		L	A	E	Q	V	D	E	S	V	T	A	G	M	N	T	F	F	A	E	F	A	S	C	L	T	E	L	Q	T	R	L	R	E	S	L	A	L	R	Q	Q	N	E	S	V	V	R	L	M	Q	Q	Q	L	Q	Q	T	V	M	T	H	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
Sequence		W	I	Y	T	D	A	Q	L	L	R	D	D	I	Q	T	L	F	T	A	E	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand