Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08622 Date Thu Jan 5 11:01:33 GMT 2012 Unique Job ID 40570adf5ff47076

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	K	Q	D	Y	Y	E	I	L	G	V	S	K	T	A	E	E	R	E	I	R	K	A	Y	K	R	L	A	M	K	Y	H	P	D	R	N	Q	G	D	K	E	A	E	A	K	F	K	E	I	K	E	A	Y	E	V	L	T	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?												?																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	K	R	A	A	Y	D	Q	Y	G	H	A	A	F	E	Q	G	G	M	G	G	G	G	F	G	G	G	A	D	F	S	D	I	F	G	D	V	F	G	D	I	F	G	G	G	R	G	R	Q	R	A	A	R	G	A	D	L	R	Y	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	E	L	T	L	E	E	A	V	R	G	V	T	K	E	I	R	I	P	T	L	E	E	C	D	V	C	H	G	S	G	A	K	P	G	T	Q	P	Q	T	C	P	T	C	H	G	S	G	Q	V	Q	M	R	Q	G	F	F	A	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?								?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	T	C	P	H	C	Q	G	R	G	T	L	I	K	D	P	C	N	K	C	H	G	H	G	R	V	E	R	S	K	T	L	S	V	K	I	P	A	G	V	D	T	G	D	R	I	R	L	A	G	E	G	E	A	G	E	H	G	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?																	?	?	?	?		?	?	?	?	?														?					?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	G	D	L	Y	V	Q	V	Q	V	K	Q	H	P	I	F	E	R	E	G	N	N	L	Y	C	E	V	P	I	N	F	A	M	A	A	L	G	G	E	I	E	V	P	T	L	D	G	R	V	K	L	K	V	P	G	E	T	Q	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	L	F	R	M	R	G	K	G	V	K	S	V	R	G	G	A	Q	G	D	L	L	C	R	V	V	V	E	T	P	V	G	L	N	E	R	Q	K	Q	L	L	Q	E	L	Q	E	S	F	G	G	P	T	G	E	H	N	S	P	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?		?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Sequence		K	S	F	F	D	G	V	K	K	F	F	D	D	L	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?											?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand