Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AG00 Date Thu Jan 5 11:27:42 GMT 2012 Unique Job ID 4018e5160322fa19

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	Q	P	M	P	G	K	P	A	E	D	A	E	N	E	L	D	I	R	G	L	F	R	T	L	W	A	G	K	L	W	I	I	G	M	G	L	A	F	A	L	I	A	L	A	Y	T	F	F	A	R	Q	E	W	S	S	T	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	D	R	P	T	V	N	M	L	G	G	Y	Y	S	Q	Q	Q	F	L	R	N	L	D	V	R	S	N	M	A	S	A	D	Q	P	S	V	M	D	E	A	Y	K	E	F	V	M	Q	L	A	S	W	D	T	R	R	E	F	W	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	D	Y	Y	K	Q	R	M	V	G	N	S	K	A	D	A	A	L	L	D	E	M	I	N	N	I	Q	F	I	P	G	D	F	T	R	A	V	N	D	S	V	K	L	I	A	E	T	A	P	D	A	N	N	L	L	R	Q	Y	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	A	S	Q	R	A	A	S	H	L	N	D	E	L	K	G	A	W	A	A	R	T	I	Q	M	K	A	Q	V	K	R	Q	E	E	V	A	K	A	I	Y	D	R	R	M	N	S	I	E	Q	A	L	K	I	A	E	Q	H	N	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	S	A	T	D	V	P	A	E	E	L	P	D	S	E	M	F	L	L	G	R	P	M	L	Q	A	R	L	E	N	L	Q	A	V	G	P	A	F	D	L	D	Y	D	Q	N	R	A	M	L	N	T	L	N	V	G	P	T	L	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?													?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	F	Q	T	Y	R	Y	L	R	T	P	E	E	P	V	K	R	D	S	P	R	R	A	F	L	M	I	M	W	G	I	V	G	G	L	I	G	A	G	V	A	L	T	R	R	C	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																												?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand