Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76192 Date Thu Jan 5 12:20:18 GMT 2012 Unique Job ID 3ff474ac8e7680f9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	N	G	W	T	G	N	I	L	R	V	N	L	T	T	G	N	I	T	L	E	D	S	S	K	F	K	S	F	V	G	G	M	G	F	G	Y	K	I	M	Y	D	E	V	P	P	G	T	K	P	F	D	E	A	N	K	L	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	T	G	P	L	T	G	S	G	A	P	C	S	S	R	V	N	I	T	S	L	S	T	F	T	K	G	N	L	V	V	D	A	H	M	G	G	F	F	A	A	Q	M	K	F	A	G	Y	D	V	I	I	I	E	G	K	A	K	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	W	L	K	I	K	D	D	K	V	S	L	E	K	A	D	F	L	W	G	K	G	T	R	A	T	T	E	E	I	C	R	L	T	S	P	E	T	C	V	A	A	I	G	Q	A	G	E	N	L	V	P	L	S	G	M	L	N	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	H	S	G	G	A	G	T	G	A	I	M	G	S	K	N	L	K	A	I	A	V	E	G	T	K	G	V	N	I	A	D	R	Q	E	M	K	R	L	N	D	Y	M	M	T	E	L	I	G	A	N	N	N	H	V	V	P	S	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?		?	?																			?	?	?	?	?			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	S	W	A	E	Y	S	D	P	K	S	R	W	T	A	R	K	G	L	F	W	G	A	A	E	G	G	P	I	E	T	G	E	I	P	P	G	N	Q	N	T	V	G	F	R	T	Y	K	S	V	F	D	L	G	P	A	A	E	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?																		?						?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	V	K	M	S	G	C	H	S	C	P	I	R	C	M	T	Q	M	N	I	P	R	V	K	E	F	G	V	P	S	T	G	G	N	T	C	V	A	N	F	V	H	T	T	I	F	P	N	G	P	K	D	F	E	D	K	D	D	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?															?	?					?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	I	G	N	L	V	G	L	N	L	F	D	D	Y	G	L	W	C	N	Y	G	Q	L	H	R	D	F	T	Y	C	Y	S	K	G	V	F	K	R	V	L	P	A	E	E	Y	A	E	I	R	W	D	Q	L	E	A	G	D	V	N	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	K	D	F	Y	Y	R	L	A	H	R	V	G	E	L	S	H	L	A	D	G	S	Y	A	I	A	E	R	W	N	L	G	E	E	Y	W	G	Y	A	K	N	K	L	W	S	P	F	G	Y	P	V	H	H	A	N	E	A	S	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	G	S	I	V	N	C	M	F	N	R	D	C	M	T	H	T	H	I	N	F	I	G	S	G	L	P	L	K	L	Q	R	E	V	A	K	E	L	F	G	S	E	D	A	Y	D	E	T	K	N	Y	T	P	I	N	D	A	K	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?									?	?																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Y	A	K	W	S	L	L	R	V	C	L	H	N	A	V	T	L	C	N	W	V	W	P	M	T	V	S	P	L	K	S	R	N	Y	R	G	D	L	A	L	E	A	K	F	F	K	A	I	T	G	E	E	M	T	Q	E	K	L	D	L
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	A	E	R	I	F	T	L	H	R	A	Y	T	V	K	L	M	Q	T	K	D	M	R	N	E	H	D	L	I	C	S	W	V	F	D	K	D	P	Q	I	P	V	F	T	E	G	T	D	K	M	D	R	D	D	M	H	A	S	L	T
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
Sequence		M	F	Y	K	E	M	G	W	D	P	Q	L	G	C	P	T	R	E	T	L	Q	R	L	G	L	E	D	I	A	A	D	L	A	A	H	N	L	L	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand