Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77649 Date Thu Jan 5 12:31:20 GMT 2012 Unique Job ID 3e99a79321d5f665

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	L	S	F	V	T	R	W	R	D	E	L	P	E	T	Y	T	A	L	S	P	T	P	L	N	N	A	R	L	I	W	H	N	T	E	L	A	N	T	L	S	I	P	S	S	L	F	K	N	G	A	G	V	W	G	G	E	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	P	G	M	S	P	L	A	Q	V	Y	S	G	H	Q	F	G	V	W	A	G	Q	L	G	D	G	R	G	I	L	L	G	E	Q	L	L	A	D	G	T	T	M	D	W	H	L	K	G	A	G	L	T	P	Y	S	R	M	G	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	A	V	L	R	S	T	I	R	E	S	L	A	S	E	A	M	H	Y	L	G	I	P	T	T	R	A	L	S	I	V	T	S	D	S	P	V	Y	R	E	T	A	E	P	G	A	M	L	M	R	V	A	P	S	H	L	R	F	G	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	E	H	F	Y	Y	R	R	E	S	E	K	V	R	Q	L	A	D	F	A	I	R	H	Y	W	S	H	L	A	D	D	E	D	K	Y	R	L	W	F	S	D	V	V	A	R	T	A	S	L	I	A	Q	W	Q	T	V	G	F	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	V	M	N	T	D	N	M	S	L	L	G	L	T	L	D	Y	G	P	F	G	F	L	D	D	Y	E	P	G	F	I	C	N	H	S	D	H	Q	G	R	Y	S	F	D	N	Q	P	A	V	A	L	W	N	L	Q	R	L	A	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	S	P	F	V	A	V	D	A	L	N	E	A	L	D	S	Y	Q	Q	V	L	L	T	H	Y	G	E	R	M	R	Q	K	L	G	F	M	T	E	Q	K	E	D	N	A	L	L	N	E	L	F	S	L	M	A	R	E	R	S	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	R	T	F	R	M	L	S	L	T	E	Q	H	S	A	A	S	P	L	R	D	E	F	I	D	R	A	A	F	D	D	W	F	A	R	Y	R	G	R	L	Q	Q	D	E	V	S	D	S	E	R	Q	Q	L	M	Q	S	V	N	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?						?																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	V	L	R	N	W	L	A	Q	R	A	I	E	A	A	E	K	G	D	M	T	E	L	H	R	L	H	E	A	L	R	N	P	F	S	D	R	D	D	D	Y	V	S	R	P	P	D	W	G	K	R	L	E	V	S	C	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand