Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76585 Date Thu Jan 5 12:24:52 GMT 2012 Unique Job ID 3e24117744b4e7d2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	P	V	K	V	W	Q	E	R	V	E	I	P	T	Y	E	T	G	P	Q	D	I	H	P	M	F	L	E	N	R	V	Y	Q	G	S	S	G	A	V	Y	P	Y	G	V	T	D	T	L	S	E	Q	K	T	L	K	S	W	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?			?						?	?	?															?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	W	L	E	N	D	Y	I	K	V	M	I	L	P	E	L	G	G	R	V	H	R	A	W	D	K	V	K	Q	R	D	F	V	Y	H	N	E	V	I	K	P	A	L	V	G	L	L	G	P	W	I	S	G	G	I	E	F	N	W	P
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Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	H	H	R	P	T	T	F	M	P	V	D	F	T	L	E	A	H	E	D	G	A	Q	T	V	W	V	G	E	T	E	P	M	H	G	L	Q	V	M	T	G	F	T	L	R	P	D	R	A	A	L	E	I	A	S	R	V	Y	N	G
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	A	T	P	R	H	F	L	W	W	A	N	P	A	V	K	G	G	E	G	H	Q	S	V	F	P	P	D	V	T	A	V	F	D	H	G	K	R	A	V	S	A	F	P	I	A	T	G	T	Y	Y	K	V	D	Y	S	A	G	V	D
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SS confidence
Disorder																																																			?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	S	R	Y	K	N	V	P	V	P	T	S	Y	M	A	E	K	S	Q	Y	D	F	V	G	A	W	C	H	D	E	D	G	G	L	L	H	V	A	N	H	H	I	A	P	G	K	K	Q	W	S	W	G	H	S	E	F	G	Q	A	W
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Disorder																																										?	?													?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	K	S	L	T	D	N	N	G	P	Y	I	E	L	M	T	G	I	F	A	D	N	Q	P	D	F	T	W	L	D	A	Y	E	E	K	R	F	E	Q	Y	F	L	P	Y	H	S	L	G	M	V	Q	N	A	S	R	D	A	V	I	K
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Disorder																																																		?	?	?	?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	Q	R	S	K	R	G	I	E	W	G	L	Y	A	I	S	P	L	N	G	Y	R	L	A	I	R	E	I	G	K	C	N	A	L	L	D	D	A	V	A	L	M	P	A	T	A	I	Q	G	V	L	H	G	I	N	P	E	R	L	T
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	E	L	S	D	A	D	G	N	I	V	L	S	Y	Q	E	H	Q	P	Q	A	L	P	L	P	D	V	A	K	A	P	L	A	A	Q	D	I	T	S	T	D	E	A	W	F	I	G	Q	H	L	E	Q	Y	H	H	A	S	R	S	P
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Disorder																	?		?	?	?	?	?	?	?					?					?	?																			?	?	?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		F	D	Y	Y	L	R	G	V	A	L	D	P	L	D	Y	R	C	N	L	A	L	A	M	L	E	Y	N	R	A	D	F	P	Q	A	V	A	Y	A	T	Q	A	L	K	R	A	H	A	L	N	K	N	P	Q	C	G	Q	A	S	L	I
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		R	A	S	A	Y	E	R	Q	G	Q	Y	Q	Q	A	E	E	D	F	W	R	A	V	W	S	G	N	S	K	A	G	G	Y	Y	G	L	A	R	L	A	A	R	N	G	N	F	D	A	G	L	D	F	C	Q	Q	S	L	R	A	C	P
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		T	N	Q	E	V	L	C	L	H	N	L	L	L	V	L	S	G	R	Q	D	N	A	R	V	Q	R	E	K	L	L	R	D	Y	P	L	N	A	T	L	W	W	L	N	W	F	D	G	R	S	E	S	A	L	A	Q	W	R	G	L	C
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		Q	G	R	D	V	N	A	L	M	T	A	G	Q	L	I	N	W	G	M	P	T	L	A	A	E	M	L	N	A	L	D	C	Q	R	T	L	P	L	Y	L	Q	A	S	L	L	P	K	A	E	R	G	E	L	V	A	K	A	I	D	V
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		F	P	Q	F	V	R	F	P	N	T	L	E	E	V	A	A	L	E	S	I	E	E	C	W	F	A	R	H	L	L	A	C	F	Y	Y	N	K	R	S	Y	N	K	A	I	A	F	W	Q	R	C	V	E	M	S	P	E	F	A	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		W	R	G	L	A	I	H	A	W	N	K	Q	H	D	Y	E	L	A	A	R	Y	L	D	N	A	Y	Q	L	A	P	Q	D	A	R	L	L	F	E	R	D	L	L	D	K	L	S	G	A	T	P	E	K	R	L	A	R	L	E	N	N
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		L	E	I	A	L	K	R	D	D	M	T	A	E	L	L	N	L	W	H	L	T	G	Q	A	D	K	A	A	D	I	L	A	T	R	K	F	H	P	W	E	G	G	E	G	K	V	T	S	Q	F	I	L	N	Q	L	L	R	A	W	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?				?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		H	L	D	A	R	Q	P	Q	Q	A	C	E	L	L	H	A	A	L	H	Y	P	E	N	L	S	E	G	R	L	P	G	Q	T	D	N	D	I	W	F	W	Q	A	I	C	A	N	A	Q	G	D	E	T	E	A	T	R	C	L	R	L
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Disorder						?																							?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		A	A	T	G	D	R	T	I	N	I	H	S	Y	Y	N	D	Q	P	V	D	Y	L	F	W	Q	G	M	A	L	R	L	L	G	E	Q	Q	T	A	Q	Q	L	F	S	E	M	K	Q	W	A	Q	E	M	A	K	T	S	I	E	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?		?			?																																								?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		F	F	A	V	S	Q	P	D	L	L	S	L	Y	G	D	L	Q	Q	Q	H	K	E	K	C	L	M	V	A	M	L	A	S	A	G	L	G	E	V	A	Q	Y	E	S	A	R	A	E	L	T	A	I	N	P	A	W	P	K	A	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.
Sequence		F	T	T	V	M	P	F	I	F	N	R	V	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?
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